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J-GLOBAL ID：201802216313136976   整理番号：18A1242816

mRNA標的上のmiRNA機械とHuR間の相互作用のトランスクリプトーム全体の同定と検証【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome-wide Identification and Validation of Interactions between the miRNA Machinery and HuR on mRNA Targets

著者 (3件)： Li Yahui (Department of Molecular, Cell and Systems Biology, Institute of Integrative Genome Biology, University of California, Riverside, CA 92521, USA) ,  Estep Jason A. (Department of Molecular, Cell and Systems Biology, Institute of Integrative Genome Biology, University of California, Riverside, CA 92521, USA) ,  Karginov Fedor V. (Department of Molecular, Cell and Systems Biology, Institute of Integrative Genome Biology, University of California, Riverside, CA 92521, USA)
資料名： Journal of Molecular Biology  (Journal of Molecular Biology)
巻： 430  号： 3  ページ： 285-296  発行年： 2018年 
JST資料番号： D0124B  ISSN： 0022-2836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： mRNAの3′非翻訳領域(UTR)は,細胞質におけるマイクロRNAとRNA結合蛋白質による転写後制御を仲介する主要な調節領域である。個々の配列特異的結合と調節から,特に3′UTR部位におけるこれらの因子間の相互作用の例が出現した。しかしながら,トランスクリプトームを横切るこのような高次調節モジュールの全体像は欠けている。ここでは,転写体ワイドレベルでのmiRNA経路のコアエフェクタ,HuR,遍在RNA結合蛋白質,およびAgo2の間の相互作用を検討した。HITS-CLIPを用いて,ヒト3′UTR上のHuR及びmiRNA結合部位をマップし,それらの共存を評価した。加えて,Ago2占有に対するHuRノックダウンの全体的効果を示し,共調節関係を示唆した。Ago2-HuR重複の部位に焦点を合わせて,13の候補をルシフェラーゼレポーターアッセイでスクリーニングした。11部位はDicerヌル細胞で確認されたようにmiRNA依存性抑制を示した。共調節におけるHuRの役割を試験するために,HuR KO細胞におけるレポーターを測定した。miRNA部位の3つは,変化した活性を示し,HuRがこれらの部位でmiRNA抑制に影響することを示した。著者らの研究はmiRNA-HuR相互作用を研究するための効率的な探索と検証システムを提示し,3′UTRにおける遺伝子発現の組合せ転写後制御の理解を拡大する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *トランスクリプトーム ,  ヒト ,  調節遺伝子 ,  結合部位 ,  細胞質 ,  *相互作用 ,  遺伝子発現 ,  *mRNA ,  RNA結合タンパク質
準シソーラス用語： 転写後調節 ,  遺伝子ノックダウン法 ,  Argonaute2蛋白質 ,  3′非翻訳領域 ,  *HuR ,  *マイクロRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： RNA結合蛋白質 ,  マイクロRNA ,  転写後調節

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (8件)： mRNA ,  標的 ,  miRNA ,  HuR ,  相互作用 ,  トランスクリプトーム ,  同定 ,  検証