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J-GLOBAL ID：201802216404680205   整理番号：18A0508574

マイクロウェルSeqによるマウス細胞アトラスのマッピング【Powered by NICT】

Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-Seq

著者 (43件)： Han Xiaoping (Center for Stem Cell and Regenerative Medicine, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou 310058, China) ,  Han Xiaoping (Stem Cell Institute, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China) ,  Wang Renying (Center for Stem Cell and Regenerative Medicine, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou 310058, China) ,  Wang Renying (Stem Cell Institute, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China) ,  Zhou Yincong (College of Life Sciences, Zhejiang University, Hangzhou 310003, China) ,  Zhou Yincong (Stem Cell Institute, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China) ,  Fei Lijiang (Center for Stem Cell and Regenerative Medicine, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou 310058, China) ,  Fei Lijiang (Stem Cell Institute, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China) ,  Sun Huiyu (Center for Stem Cell and Regenerative Medicine, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou 310058, China) ,  Sun Huiyu (Stem Cell Institute, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China) ,  Lai Shujing (Center for Stem Cell and Regenerative Medicine, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou 310058, China) ,  Lai Shujing (Stem Cell Institute, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China) ,  Saadatpour Assieh (Department of Biostatistics and Computational Biology, Dana-Farber Cancer Institute, Harvard School of Public Health, Boston, MA 02115, USA) ,  Zhou Zimin (Center for Stem Cell and Regenerative Medicine, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou 310058, China) ,  Zhou Zimin (Stem Cell Institute, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China) ,  Chen Haide (Center for Stem Cell and Regenerative Medicine, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou 310058, China) ,  Chen Haide (Stem Cell Institute, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China) ,  Ye Fang (Center for Stem Cell and Regenerative Medicine, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou 310058, China) ,  Ye Fang (Stem Cell Institute, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China) ,  Huang Daosheng (Center for Stem Cell and Regenerative Medicine, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou 310058, China) ,  Xu Yang (Center for Stem Cell and Regenerative Medicine, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou 310058, China) ,  Huang Wentao (Center for Stem Cell and Regenerative Medicine, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou 310058, China) ,  Jiang Mengmeng (Center for Stem Cell and Regenerative Medicine, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou 310058, China) ,  Jiang Mengmeng (Stem Cell Institute, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China) ,  Jiang Xinyi (Center for Stem Cell and Regenerative Medicine, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou 310058, China) ,  Jiang Xinyi (Stem Cell Institute, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China) ,  Mao Jie (Institute of Applied Mechanics, Zhejiang University, Hangzhou 310027, China) ,  Chen Yao (Department of Reproductive Endocrinology, Women’s Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou 310058, China) ,  Lu Chenyu (Research Center of Infection and Immunity, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou 310058, China) ,  Xie Jin (State Key Laboratory of Fluid Power and Mechatronic Systems, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China) ,  Fang Qun (Institute of Microanalytical Systems, Department of Chemistry, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China) ,  Wang Yibin (Institute for Regenerative Medicine, Shanghai East Hospital, School of Life Sciences and Technology, Tongji University, Shanghai 200092, China) ,  Yue Rui (Institute for Regenerative Medicine, Shanghai East Hospital, School of Life Sciences and Technology, Tongji University, Shanghai 200092, China) ,  Li Tiefeng (Institute of Applied Mechanics, Zhejiang University, Hangzhou 310027, China) ,  Huang He (Institute of Hematology, the First Affiliated Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou 310003, China) ,  Huang He (Stem Cell Institute, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China) ,  Orkin Stuart H. (Division of Pediatric Hematology/Oncology, Dana Farber Cancer Institute and Boston Children’s Hospital, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA) ,  Yuan Guo-Cheng (Department of Biostatistics and Computational Biology, Dana-Farber Cancer Institute, Harvard School of Public Health, Boston, MA 02115, USA) ,  Chen Ming (College of Life Sciences, Zhejiang University, Hangzhou 310003, China) ,  Chen Ming (Stem Cell Institute, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China) ,  Guo Guoji (Center for Stem Cell and Regenerative Medicine, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou 310058, China) ,  Guo Guoji (Institute of Hematology, the First Affiliated Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou 310003, China) ,  Guo Guoji (Stem Cell Institute, Zhejiang University, Hangzhou 310058, China)
資料名： Cell (Cambridge, Mass.)  (Cell (Cambridge, Mass.))
巻： 172  号： 5  ページ： 1091-1107.e17  発行年： 2018年 
JST資料番号： A0707B  ISSN： 0092-8674  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 単細胞RNA配列決定(scRNA seq)技術は,現在の細胞型分類システムを再形成しようとしている。しかし,トランスクリプトームに基づく単細胞アトラスは複雑な哺乳類系で達成されていない。ここでは,マイクロウェルseq,簡単で安価な装置を用いた高スループットかつ低コストなscRNA seqプラットフォームを開発した。マイクロウェルseqを用いて,主要なマウス器官の全てをカバーする400,000以上の単一細胞を分析し,マウス細胞アトラス(MCA)のための基本スキームを構築した。はこれまで特性化されていない多くの組織のための単一細胞階層を明らかにした。単一細胞ディジタル発現に基づく細胞タイプを定義する正確にWebベースの「単一細胞MCA(最大共分散解析)」パイプラインを構築した。著者らの研究は,マイクロウェルseq技術とMCA資源の広い適用性を実証した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： キャラクタリゼーション ,  トランスクリプトーム ,  ディジタル方式 ,  哺乳類 ,  Web【情報システム】 ,  適応性 ,  分散分析 ,  *RNA【核酸】 ,  不均一性
準シソーラス用語： scRNA ,  ハイスループット ,  細胞型 ,  単一細胞 ,  *アトラス ,  *マイクロウェル , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (10件)： 単一細胞RNA-seq ,  マウス細胞地図 ,  マイクロウェルseq ,  scMCA解析 ,  哺乳類細胞地図 ,  細胞不均一性 ,  断面組織細胞ネットワーク ,  細胞型分類 ,  単一細胞解析 ,  トランスクリプトーム解析

分類 (2件)： 細胞生理一般  (EF02010S) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： マイクロウェル ,  マウス ,  細胞アトラス ,  マッピング