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J-GLOBAL ID：201802217596895166   整理番号：18A0965952

二倍体ワタ(Gossypium arboreum L.)における繊維発生中に発現する遺伝子の転写プロファイリング【JST・京大機械翻訳】

Transcript profiling of genes expressed during fibre development in diploid cotton ( Gossypium arboreum L.)

著者 (10件)： Hande Atul S. (University of Agricultural Sciences, Dharwad, India) ,  Katageri Ishwarappa S. (University of Agricultural Sciences, Dharwad, India) ,  Jadhav Mangesh P. (University of Agricultural Sciences, Dharwad, India) ,  Adiger Sateesh (University of Agricultural Sciences, Dharwad, India) ,  Gamanagatti Savita (University of Agricultural Sciences, Dharwad, India) ,  Padmalatha Kethireddy Venkata (National Research Centre on Plant Biotechnology (NRCPB), IARI, New Delhi, India) ,  Dhandapani Gurusamy (National Research Centre on Plant Biotechnology (NRCPB), IARI, New Delhi, India) ,  Kanakachari Mogilicherla (National Research Centre on Plant Biotechnology (NRCPB), IARI, New Delhi, India) ,  Kumar Polumetla Ananda (National Research Centre on Plant Biotechnology (NRCPB), IARI, New Delhi, India) ,  Reddy Vanga Siva (Plant Transformation Group, International Centre for Genetic Engineering & Biotechnology (ICGEB), New Delhi, India)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 675  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】Cotton繊維は単一細胞であり,それは繊維発生の様々な段階の間に発現する遺伝子を明らかにするための最良のプラットフォームの1つである。四倍体栽培ワタにおける繊維細胞開始と伸長に関する比較トランスクリプトーム研究に関する報告がある。しかしながら,本研究において,同質遺伝子ファジー-リント(Fl)を用いて二倍体栽培ワタにおいて比較トランスクリプトーム研究を行った。そして,Affymetrixワタ遺伝子チップゲノムアレイを用いて,2段階,0および10dpa(開花後)における二倍体種,Gossypium arboreumに属した。【結果】走査電子顕微鏡(SEM)分析は,-2および0dpaにおけるNormal FLにおける多くと比較して,Flラインにおける少数の繊維細胞初期の発生を明らかにした。しかしながら,10dpaでは,Flで伸長した繊維細胞はなかったが,多くの伸長細胞がFL系統で見出された。転写因子,AP2-EREBP,C2H2,C3H,HB及びWRKYのアップレギュレーションが0dpaで観察されたが,10dpa転写因子ではAP2-EREBP,AUX/IAA,bHLH,C2H2,C3H,HB,MYB,NAC,オーファン,Platz及びWRKYがFl系統でダウンレギュレーションされた。これらの転写因子は主に植物ホルモンシグナル伝達,細胞のエネルギー代謝,脂肪酸代謝,二次代謝及び他のシグナル伝達経路のような代謝経路に関与し,繊維発生に直接又は間接的に関連する。定量的リアルタイムPCRを行い,0および10dpaにおける正常と比較して,突然変異体においてダウンレギュレーションされたこれらの遺伝子および転写因子(TF)の折畳みまたはダウンレギュレーションをチェックした。結論:本研究は,AP2-EREBP,C2H2,C3H,HB,WRKYおよび植物ホルモンシグナル伝達遺伝子のような転写因子の0dpaでのアップレギュレーションと10dpaでのそれらのダウンレギュレーションが,ファジーな線における線維伸長を抑制する可能性があることを明らかにした。VLCFA鎖の合成に関与する遺伝子のダウンレギュレーションと共に,エネルギーと細胞壁代謝に必要な転写物,エクスパンシン,アラビノガラクタン蛋白質(AGPs),チューブリンは,Flにおける繊維の成長低下の理由となる可能性がある。植物受容体様キナーゼ(RLK),Leucine Rich Repeats)LRRファミリー蛋白質及びマイトジェン活性化蛋白質キナーゼ(MAPK)カスケードをコードするシグナル伝達は細胞伸長及びSCW生合成の協調に関与し,これらのダウンレギュレーションは繊維成長を低下させる機能を低下させる可能性がある。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ダウンレギュレーション ,  トランスクリプトーム ,  アップレギュレーション ,  生合成 ,  代謝経路 ,  *遺伝子 ,  植物ホルモン ,  *二倍体 ,  転写因子 ,  細胞壁 ,  エネルギー代謝 ,  MAPキナーゼ ,  開花
準シソーラス用語： WRKY蛋白質 ,  *Gossypium arboreum , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 二倍体ワタ ,  マイクロアレイ ,  QRT PCR ,  転写因子

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (46件)：

• AES Bioflux; Cotton fibers: attributes of specialized cells and factors affecting them; J Farooq, A Farooq, M Rizwan, IV Petrescu-Mag, MA Ali, K Mahmood, A Batool; 7; 3; 2015; 369-382; CR1;
• Int J Plant Genomics; Recent advances in cotton genomics; HB Zhang, Y Li, B Wang, PW Chee; 2008; 2008; 742304; 10.1155/2008/742304; CR2;
• Am J Bot; Genetic diversity in Gossypium hirsutum and the origin of upland cotton; JF Wendel, CL Brubaker, AE Percival; 79; 1992; 1291-1310; 10.2307/2445058; CR3;
• Ann Bot; Gene expression changes and early events in cotton fibre development; JJ Lee, AW Woodward, ZJ Chen; 100; 7; 2007; 1391-1401; 10.1093/aob/mcm232; CR4;
• Fan L, Hu W, Yang Y, Li B. Plant Special Cell - Cotton Fiber. Dr. John Mworia editors. Botany. InTech, Janeza Trdine 9, 51000 Rijeka, Croatia: 2012. p. 211-226.

タイトルに関連する用語 (7件)： 二倍体 ,  ワタ ,  Gossypium ,  繊維 ,  発現 ,  遺伝子 ,  転写プロファイリング