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J-GLOBAL ID：201802217966588967   整理番号：18A0790548

遺伝的変異を可視化する経路ベース分析ツールのレビュー【JST・京大機械翻訳】

A Review of Pathway-Based Analysis Tools That Visualize Genetic Variants

著者 (3件)： Cirillo Elisa (Department of Bioinformatics - BiGCaT, Maastricht University) ,  Parnell Laurence D. (Jean Mayer-USDA Human Nutrition Research Center on Aging at Tufts University, Agricultural Research Service, USDA) ,  Evelo Chris T. (Department of Bioinformatics - BiGCaT, Maastricht University)
資料名： Frontiers in Genetics (Web)  (Frontiers in Genetics (Web))
巻： 8  ページ： 174  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7071A  ISSN： 1664-8021  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 経路分析は,遺伝子発現分析に最も頻繁に適用されるゲノミクスにおけるデータ解析のための強力な方法である。それは,影響された遺伝子と蛋白質が関与する生物学的過程に関する変異体の解釈を可能にするので,ゲノムワイド関連研究データのような単一ヌクレオチド多型(SNP)データ解析にも有望である。このような分析は,遺伝子産物の機能,調節または相互作用に及ぼす変動の可能な影響の相互作用評価を支持する。現在の経路解析ソフトウェアは,遺伝的関連結果を解釈するための代替法としての経路における変異体のデータ可視化をしばしば支持せず,SNPデータの経路解析のための特異的統計的方法はこれらの可視化特徴と結合しない。本レビューでは,この開発分野における改善のための洞察を提供するために,文献レビューによって同定されたツールの可視化オプションを最初に記述した。肥満リスクに対する遺伝子-遺伝子相互作用の計算上位データセットを用いてツール評価を行った。次に,SNPデータによる経路ベース解析のために設計されたこれらのツール統計的手法に含まれる必要性を報告し,より包括的な経路ベース解析ツールの特徴を定義することを目的とした。遺伝的変異データの経路解析は,評価した種々のツールの最も有用で有益な視覚的側面の複雑な組合せを必要とすることを認識することにより結論した。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  データ解析 ,  遺伝子発現 ,  統計的方法 ,  文献展望 ,  遺伝子 ,  肥満 ,  *可視化 ,  ソフトウェア ,  一塩基多型
準シソーラス用語： 遺伝子相互作用 ,  データ可視化 ,  ゲノミクス ,  *解析ツール ,  *遺伝的変異 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ゲノムワイド関連研究 ,  SNP ,  経路解析 ,  エピepist ,  ソフトウェア比較 ,  データ可視化

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (5件)： 遺伝的変異 ,  可視化 ,  経路 ,  分析ツール ,  レビュー