文献

J-GLOBAL ID：201802218300445459   整理番号：18A0838462

ATPとADPアクチン状態の間の機械的差異:分子動力学研究【JST・京大機械翻訳】

Mechanical differences between ATP and ADP actin states: A molecular dynamics study

著者 (2件)： Mehrafrooz Behzad (Department of Mechanical Engineering, Sharif University of Technology, Tehran, Iran) ,  Shamloo Amir (Department of Mechanical Engineering, Sharif University of Technology, Tehran, Iran)
資料名： Journal of Theoretical Biology  (Journal of Theoretical Biology)
巻： 448  ページ： 94-103  発行年： 2018年 
JST資料番号： A0288B  ISSN： 0022-5193  CODEN： JTBIA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本論文は,アクチン単量体のナノ機械的挙動の包括的な原子論的モデリングを与えることを目的とした。アクチンは多くの異なる細胞構造を形成する細胞骨格の普遍的で必須な成分である。アクチンフィラメントの機械的性質の研究には数年大きな努力が払われているが,アクチン単量体のナノ機械的挙動に関する研究はまだ不足している。しかしながら,これらのスケールは,細胞骨格構造における重要な成分としてアクチンの役割を完全に理解するために重要である。分子動力学シミュレーションのような原子論的モデル化法の精度に基づいて,軸方向および横方向を含む異なるタイプの機械的負荷下での単量体G-アクチン分子の張力を評価するために,分子動力学法を行った。結果として,水溶液中での応力-ひずみ曲線は,ヌクレオチド結合ポケットに結合したATPまたはADPのいずれかで得られた。得られた結果は,横方向および垂直方向における単一アクチン単量体の引張剛性の評価をもたらした。ATPとADP G-アクチンの挙動を比較するために,ヌクレオチドと蛋白質の間の水素結合と非結合相互作用の数を分析した。さらに,アクチン単量体の機械的挙動に及ぼす,段階的分子動力学の仮想スプリングの影響を研究した。結果は,仮想ばね定数の増加が剛性の収束をもたらすことを明らかにした。さらに,本論文では,得られた結果をアクチンフィラメントに対する単量体G-アクチンスケールに拡張するための一般化モデルを提案した。著者らのモデリングは,実験的測定に近いアクチンフィラメント15.41μmの持続長さを推定した。さらに,本論文では,破壊力アクチン-アクチン結合を,段階的分子動力学シミュレーションを用いて評価した。引張力を適用することにより,アクチン-アクチン結合は4197.5pNで破裂した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： Young率 ,  剛性 ,  ヌクレオチド ,  単量体 ,  応力歪曲線 ,  張力 ,  水溶液 ,  アクチンフィラメント ,  *アクチン ,  *分子動力学 ,  水素結合 ,  計算機シミュレーション ,  細胞骨格 ,  モデリング
準シソーラス用語： Gアクチン ,  分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： アクチンフィラメント ,  Gアクチン ,  分子動力学シミュレーション ,  生体力学 ,  ナノメカニクス ,  Young率 ,  持続長

分類 (2件)： 細胞構成体一般  (EF03010Z) ,  分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： ATP ,  ADP ,  アクチン ,  差異 ,  分子動力学 ,  研究