文献

J-GLOBAL ID：201802218324009135   整理番号：18A1382615

クリーピングベントグラス(Agrostis stolonifera L.)における熱応答性マイクロRNAのプロファイリング【JST・京大機械翻訳】

Profiling of Heat-Responsive microRNAs in Creeping Bentgrass (Agrostis stolonifera L.)

著者 (5件)： Liu Haizhen (National Engineering Laboratory of Tree Breeding, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China) ,  Li Jian (National Engineering Laboratory of Tree Breeding, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China) ,  Chen Yongkun (National Engineering Laboratory of Tree Breeding, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China) ,  Xu Yan (School of Theoretical and Applied Science, Ramapo College of New Jersey, Mahwah, NJ 07430, United States) ,  Xu Jichen (National Engineering Laboratory of Tree Breeding, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China)
資料名： Current Bioinformatics  (Current Bioinformatics)
巻： 13  号： 3  ページ： 319-327  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2353A  ISSN： 1574-8936  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 不明 (ARE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:マイクロRNA(miRNA)は非コード化一本鎖小RNAのクラスであり,非生物的ストレスに対して重要な役割を果たす。高温は,植物がそれらの成長と発達の間に苦しんだ主要な有害性の1つである。目的:本研究では,可能な熱抵抗機構を特性化するために,クレピングベントグラスにおけるmiRNAをプロファイル化することを意図した。【方法】:ベントグラスのために処理された正常および42°Cの高温は,ハイスループット小RNA塩基配列決定によって扱われた。既知及び新規miRNAを見出し,RT-qPCRを用いてそれらの標的遺伝子を予測し,配列決定結果を確認した。結果:ハイスループット小RNA塩基配列決定の結果は,42のmiRNAファミリーの182の保存されたmiRNA配列と,20と21のヌクレオチドの長さにおいて,主にクレピングベントグラス葉サンプルにおける10の新しいmiRNAを示した。バイオインフォマティクス分析は,84の保存された4つの新規miRNAが,それぞれ,熱によって制御された上方(51)または下方(37)のどちらかであることを示した。遺伝子オントロジーの濃縮とGeneの京都 EncyclopediaおよびmiRNAの標的遺伝子のゲノム経路分析は,それらが植物ホルモンシグナル伝達,植物-病原体相互作用およびポリエーテル脂質代謝に主に関与していることを示した。15のランダムに選択した熱応答性miRNAをリアルタイム定量的PCRにより調べ,熱処理中に変動する発現パターンを示した。結論:本研究は,miRNAにより仲介される高温ストレスに対する遺伝子調節ネットワークへの洞察を得ることに成功し,ストレス指向遺伝子工学に対する有意な価値を提供する。Copyright 2018 Bentham Science Publishers All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： リアルタイムPCR法 ,  キャラクタリゼーション ,  高温 ,  *ヌクレオチド配列 ,  ゲノム ,  定量的PCR法 ,  暑熱ストレス ,  植物ホルモン ,  病原体 ,  ヌクレオチド ,  相互作用
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  ハイスループット ,  低分子RNA ,  *マイクロRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Agrostis stolonifera L. ,  高温ストレス ,  miRNA ,  リアルタイムPCR ,  標的遺伝子

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (5件)： クリーピングベントグラス ,  Agrostis ,  熱応答性 ,  マイクロRNA ,  プロファイリング