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J-GLOBAL ID:201802218338330412   整理番号:18A0755293

2つの地理的に異なる地域の分離株における外膜蛋白質のHOMファミリーの比較分析:米国と韓国【JST・京大機械翻訳】

Comparative analysis of the Hom family of outer membrane proteins in isolates from two geographically distinct regions: The United States and South Korea
著者 (10件):
資料名:
巻: 23  号:ページ: e12461  発行年: 2018年 
JST資料番号: W2595A  ISSN: 1083-4389  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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背景:Helicobacter pyloriは多数の外膜蛋白質(OMP)をコードしているが,深さにおいてはわずかしか特性化されていない。多くのH.pylori OMPの欠失,重複,および対立遺伝子変異が報告されており,これらの蛋白質が宿主適応において重要な役割を果たしている可能性があることを示唆している。ここでは,2つの地理的に異なる個体群から得られたH.pyloriにおけるOMPのHomファミリー内で観察された変化を特性化した。【材料と方法】hom遺伝子のPCR遺伝子タイピングを,韓国と米国の臨床分離株を用いて実施した。統計的,系統発生学的および蛋白質モデリング分析の組合せを行い,hom変異体をさらに特性化した。結果:密接に関係したhom遺伝子,HOMAおよびHOMBの変化は,環境に曝露されたループをコードすると予測される領域で生じる。HOMC~Sについては,HOMC~Lと比較して,類似の現象が真である。逆に,HOMDではほとんど変化は観察されなかった。蛋白質のHomファミリーのある変異体は,米国からの分離株と比較して韓国の個体群からの分離株においてより顕著であった。結論:著者らのデータは,HOMA,HOMBおよびHOMCプロフィールが,系統の地理的起源に基づいて変化することを示した。しかしながら,HOMDの4番目のメンバーはより高度に保存されている。さらに,蛋白質トポロジーモデリングにより,HOMAとHOMBの間のより良く保存されていない領域の多くとHOMC~SとHOMC~Lの間の多くが予測された環境曝露ループに対応することを示し,Homファミリーの発散が宿主適応/圧力に起因する可能性があることを示唆した。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
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微生物の生化学 

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