抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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Stenotrophomonas属(Gammaproteobacteria)は広い環境分布を持っている。Stenotrophomonas maltophiliaは,それが世界的に出現している多剤耐性(MDR),日和見病原体であるので,最も良く知られている種である。この種のメンバーは高い遺伝的,生態学的及び表現型多様性を示し,いわゆるS.maltophilia複合体(Smc)を形成することが知られている。不均一抵抗性と病原性表現型は,多様な生態学的起源の環境Smc分離株について報告されている。この不均一性はSmcにおけるいくつかの潜在的な種の潜在的な集中によるものと仮定した。ここでは,最先端の系統発生学的および集団遺伝学的方法を用いて,この仮説を,pubmlst.orgにおける属に対して利用可能な多座データセットに基づいて試験した。それは,完全およびドラフトゲノム配列からの配列で拡張され,参照配列の包括的セットを組み立てた。この枠組みを用いて,メキシコ中央部の4河川と河川の堆積物と水柱から本研究で得られた108の環境分離株を分析し,人為的汚染の対照レベルにより影響を受けた。本研究の目的は,この収集における種を同定し,遺伝的凝集配列クラスタとして定義し,それらの遺伝的,生態学的および表現型分化の程度を決定することであった。Bayes因子分析と結合した多種の石炭を用いて,種の境界を区切り,個体群の遺伝的構造解析,組換えおよび配列クラスタ間の遺伝子流動推定を行った。これらの分析は,Smcが少なくとも5つの有意に分化した系統を含むことを一貫して明らかにした:S.maltophiliaとSmc1からSmc4。S.maltophiliaのみが本質的にMDRであることが見出され,全てのメンバーはメタロ-β-ラクタマーゼ(MBL)を発現していた。他のSmc系統はMDRではなく,MBLを発現しなかった。また,S.acidaminimophila,S.humiおよびS.terraeに関連する分離株を得た。それらはS.maltophiliaよりも抗生物質に対して有意に感受性であった。著者らは,多様な多変量解析とロバストな単変量統計試験によって示されるように,同所性系統が回復したことを示す。著者らは,これらのデータに良く適合する細菌種分化の現在のモデルに照らしてデータを議論し,生態学的,進化的および臨床研究における種の微妙化の意味を強調する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
