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J-GLOBAL ID：201802218634109717   整理番号：18A0352945

転写因子標的遺伝子のDamIDプロファイリングにおける立体効果の解析【Powered by NICT】

Analysis of steric effects in DamID profiling of transcription factor target genes

著者 (14件)： Ramialison Mirana (Victor Chang Cardiac Research Institute, Darlinghurst, NSW 2010, Australia) ,  Ramialison Mirana (Australian Regenerative Medicine Institute, Monash University, Clayton, VIC 3800, Australia) ,  Ramialison Mirana (Systems Biology Institute, Australia) ,  Waardenberg Ashley J. (Victor Chang Cardiac Research Institute, Darlinghurst, NSW 2010, Australia) ,  Waardenberg Ashley J. (Children’s Medical Research Institute, University of Sydney, 214 Hawkesbury Road, Westmead, NSW 2145, Australia) ,  Schonrock Nicole (Garvan Institute of Medical Research, Darlinghurst, NSW 2010, Australia) ,  Schonrock Nicole (St. Vincent’s Clinical School, University of New South Wales, Kensington 2052, Australia) ,  Doan Tram (Victor Chang Cardiac Research Institute, Darlinghurst, NSW 2010, Australia) ,  de Jong Danielle (Victor Chang Cardiac Research Institute, Darlinghurst, NSW 2010, Australia) ,  Bouveret Romaric (Victor Chang Cardiac Research Institute, Darlinghurst, NSW 2010, Australia) ,  Bouveret Romaric (St. Vincent’s Clinical School, University of New South Wales, Kensington 2052, Australia) ,  Harvey Richard P. (Victor Chang Cardiac Research Institute, Darlinghurst, NSW 2010, Australia) ,  Harvey Richard P. (St. Vincent’s Clinical School, University of New South Wales, Kensington 2052, Australia) ,  Harvey Richard P. (School of Biotechnology and Biomolecular Sciences, University of New South Wales, Kensington 2052, Australia)
資料名： Genomics  (Genomics)
巻： 109  号： 2  ページ： 75-82  発行年： 2017年 
JST資料番号： T0422A  ISSN： 0888-7543  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DNAアデニンメチルトランスフェラーゼ同定(DamID)はクロマチン結合蛋白質による標的DNA領域を検出するための酵素的技術である。蛋白質は細菌のDNAアデニンメチルトランスフェラーゼ(Dam)に融合し,培養細胞あるいは全生物で発現している。DamIDを用いて心特異的転写因子(TF)NKX2-5とSRF,普遍的に発現される補因子ELK1とELK4による結合したDNA領域を検出した。ダムとN及びC末端融合体としてこれらのTFにより結合されたターゲットを比較し,先天性心疾患で見られるものに類似した野生型(WT)NKX2-5と変異体蛋白質に対して同じであった。全体として,DamIDは高度に精巧である:WTダム融合の配向は標的集合の大きさに影響を与えることができるが,それらの特徴は再現性があった。ホメオドメインを欠く重篤なNKX2-5変異体は標的発見に負の影響を及ぼす強い立体効果を示した。立体効果の程度は問題の蛋白質とダム融合の配向に依存すると思われる。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 先天性心疾患 ,  補因子 ,  培養細胞 ,  酵素 ,  ダム ,  クロマチン ,  タンパク質 ,  DNA【核酸】 ,  *立体効果 ,  細菌 ,  再現性 ,  野生型 ,  *転写因子
準シソーラス用語： 結合蛋白質 ,  *標的遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 先天性心疾患 ,  DNAアデニンメチルトランスフェラーゼ同定(DamID) ,  NKX2-5 ,  品質管理 ,  立体効果

分類 (2件)： 先天性疾患・奇形一般  (GD03010V) ,  循環系の疾患  (GJ03000C)

タイトルに関連する用語 (5件)： 転写因子 ,  標的遺伝子 ,  プロファイリング ,  立体効果 ,  解析