分化している新生マウス水晶体上皮と線維細胞の包括的空間-時間トランスクリプトーム解析【JST・京大機械翻訳】

Zhao Yilin; Zhao Yilin; Zheng Deyou; Zheng Deyou; Zheng Deyou; Zheng Deyou; Cvekl Ales; Cvekl Ales

文献

J-GLOBAL ID：201802218637487769 整理番号：18A1813405

分化している新生マウス水晶体上皮と線維細胞の包括的空間-時間トランスクリプトーム解析【JST・京大機械翻訳】

A comprehensive spatial-temporal transcriptomic analysis of differentiating nascent mouse lens epithelial and fiber cells

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資料名：
巻： 175 ページ： 56-72 発行年： 2018年
JST資料番号： E0658B ISSN： 0014-4835 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

眼レンズの分子組成と組織の両方の解明は,多能性幹細胞のin vitroでの分化を用いた水晶体発生と疾患をモデル化するのと同様に,その発生,機能,病理学,再生能力を理解するための必要条件である。レンズはレンズのバルクを形成する前部レンズ上皮と後部レンズ線維から構成されている。水晶体線維は,細胞伸長,細胞の蓄積,細胞骨格および膜リモデリング,および水晶体の中心領域内のオルガネラの分解を含む細胞周期出口結合分化を介して水晶体上皮細胞から分化する。ここでは,RNA-seqにより,4つの発生時点(胚[E]日14.5,E16.5,E18.5,およびP0.5)におけるマイクロ解剖マウス新生水晶体上皮および水晶体線維からのmRNAおよび非コードRNAの両方の空間時間的発現動力学をプロファイリングした。この重要な時間窓の間,複数の複雑な生合成と異化過程がレンズ透明性のための分子的および構造的基礎を生み出す。この発生ウインドウを通して,3544および3518の遺伝子は,それぞれ新生水晶体上皮および線維において一貫して有意により大きな発現を示した。包括的データ解析により,FGF-MAPK,Wnt/β-カテニン,PI3K/AKT,TGF-β及びBMPシグナル伝達経路の主要な役割を確認し,水晶体形成におけるmTOR,EIF2,eIF4及びp70S6Kシグナル伝達の有意な新規寄与を明らかにした。上皮と線維細胞間の一貫した発現変化を伴うこれらの遺伝子のプロモーター領域内の不偏性モチーフ分析は,Arntl2,Dmrta2,Stat5a,Stat5b,およびTulp3のような,確立された(例えばE2F,Etv5,HSF4,c-Maf,MafG,MafK,N-Myc,およびPax6)転写因子と多くの新規調節因子を明らかにした。結論として,本RNA-seqデータは,正常哺乳類水晶体分化の分子原理を解読するための包括的参照資源として役立ち,両方の水晶体コンパートメントにおいて作動するシグナル伝達経路とDNA結合転写因子の完全スペクトルをマッピングし,レンズ透明性を確立するために必要な新規経路を予測する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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発生と分化 , 視覚

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