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J-GLOBAL ID：201802218736356909   整理番号：18A1115935

マウスからのナイーブおよびメモリーCD4+細胞における加齢のトランスクリプトームプロファイル【JST・京大機械翻訳】

Transcriptomic profiles of aging in naieve and memory CD4 + cells from mice

著者 (10件)： Taylor Jackson (Department of Epidemiology & Prevention, Public Health Sciences, Wake Forest School of Medicine, Winston-Salem, USA) ,  Taylor Jackson (Department of Internal Medicine, Wake Forest School of Medicine, Winston-Salem, USA) ,  Taylor Jackson (Present Address: Department of Molecular Biology, Cell Biology, Biochemistry at Brown University, Providence, USA) ,  Reynolds Lindsay (Department of Epidemiology & Prevention, Public Health Sciences, Wake Forest School of Medicine, Winston-Salem, USA) ,  Hou Li (Department of Epidemiology & Prevention, Public Health Sciences, Wake Forest School of Medicine, Winston-Salem, USA) ,  Lohman Kurt (Department of Epidemiology & Prevention, Public Health Sciences, Wake Forest School of Medicine, Winston-Salem, USA) ,  Cui Wei (Department of Epidemiology & Prevention, Public Health Sciences, Wake Forest School of Medicine, Winston-Salem, USA) ,  Kritchevsky Stephen (Department of Internal Medicine, Wake Forest School of Medicine, Winston-Salem, USA) ,  McCall Charles (Department of Internal Medicine, Wake Forest School of Medicine, Winston-Salem, USA) ,  Liu Yongmei (Department of Epidemiology & Prevention, Public Health Sciences, Wake Forest School of Medicine, Winston-Salem, USA)
資料名： Immunity & Ageing (Web)  (Immunity & Ageing (Web))
巻： 14  号： 1  ページ： 15  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7323A  ISSN： 1742-4933  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】CD4+T細胞は,広範囲にナイーブおよび記憶サブセットに分割することができ,それらの各々は,老化過程によって差別的に障害される。これらの差異がトランスクリプトームレベルで反映されるかどうかは不明である。両方のサブセットにおける年齢関連機能変化の機構をより良く理解するために,若い(2~3か月)および古い(28か月)マウスから誘導されたナイーブ(CD44~低)および記憶(CD44~高)CD4+T細胞から誘導されたRNAについてマイクロアレイプロファイリングを行った。また,これらのサブセットの両方における遺伝子発現変化の機能的結果を決定するために,また,これらの変化に関与する可能性のある調節因子を同定するために,バイオインフォマティクス解析を実施した。【結果】著者らは,若い対古いナイーブおよび記憶細胞において,それぞれ185および328の遺伝子が差別的に発現(FDR≦0.05)し,50の遺伝子が両方のサブセットにおいて差別的に発現していることを見出した。機能的アノテーション分析は,老化したナイーブ細胞に特異的なアポトーシスに関与する遺伝子の増加を強調した。両サブセットは,酸化的リン酸化遺伝子の減少と共に,炎症性シグナル伝達遺伝子の年齢関連増加を共有した。cis-調節分析は,年齢関連発現,特にNF-κBおよびいくつかのフォークヘッドボックス転写因子における遺伝子近くの複数の転写因子結合部位の濃縮を明らかにした。エンハンサー関連ヒストン修飾は,ナイーブ細胞でダウンレギュレーションされた遺伝子の近くで濃縮された。著者らの結果と以前のマウスおよびヒトのデータセットとの比較は,全体的に重複する遺伝子をほとんど示さないが,マウスおよびヒトCD4+T細胞の両方において,Cap1およびIL1R2の一貫したアップレギュレーションおよびFoxp1のダウンレギュレーションを示唆する。【結論】ナイーブおよび記憶CD4+T細胞のトランスクリプトームは,老化過程によって明らかに影響を受ける。しかし,両サブセットは共通の炎症性遺伝子の増加と酸化的リン酸化遺伝子の減少を示す。NF-κB,フォークヘッドボックス及びMyc転写因子は,両サブセットにおけるこれらの遺伝子発現変化の上流調節因子として関与し,エンハンサーヒストン修飾はナイーブ細胞にユニークなユニークな変化を駆動する可能性がある。最後に,ヒトとマウスの間の年齢関連遺伝子発現変化における重なりはほとんどないと結論した。しかしながら,遺伝子の小部分集合における年齢関連変化は保存されている可能性がある。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アップレギュレーション ,  遺伝子発現 ,  ヒト ,  部分集合 ,  RNA【核酸】 ,  T細胞 ,  炎症 ,  アポトーシス ,  アノテーション ,  遺伝子 ,  ダウンレギュレーション ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： ヒストン修飾 ,  バイオインフォマティクス ,  CD4陽性T細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 加齢 ,  T細胞 ,  CD4+ ,  トランスクリプトーム ,  NFKB ,  エンハンサー ,  炎症

分類 (1件)： 免疫反応一般  (ED03010T)

引用文献 (55件)：

• J Immunol; Naive T Cell Maintenance and Function in Human Aging; JJ Goronzy, F Fang, MM Cavanagh, Q Qi, CM Weyand; 194; 2015; 4073-80; 10.4049/jimmunol.1500046; CR1;
• J Immunol; Aging of the T cell compartment in mice and humans: from no naive expectations to foggy memories; J Nikolich-Žugich; 193; 2014; 2622-9; 10.4049/jimmunol.1401174; CR2;
• Nat Immunol; Understanding immunosenescence to improve responses to vaccines; JJ Goronzy, CM Weyand; 14; 2013; 428-36; 10.1038/ni.2588; CR3;
• Cell Mol Life Sci; Immune aging and autoimmunity; JJ Goronzy, CM Weyand; 69; 2012; 1615-23; 10.1007/s00018-012-0970-0; CR4;
• Mech Ageing Dev; Defect of autologous mixed lymphocyte reaction and interleukin-2 in aged individuals; GW Canonica, G Ciprandi, M Caria, W Dirienzo, A Shums, B Norton-koger; 32; 1985; 205-12; 10.1016/0047-6374(85)90080-6; CR5;

タイトルに関連する用語 (4件)： マウス ,  メモリー ,  CD4+細胞 ,  加齢