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J-GLOBAL ID：201802218983393607   整理番号：18A0356271

対照臨床的重症度とヒト皮膚リーシュマニア症をきたしたチュニジアLeishmania major分離株の比較ゲノミクス【Powered by NICT】

Comparative genomics of Tunisian Leishmania major isolates causing human cutaneous leishmaniasis with contrasting clinical severity

著者 (17件)： Ghouila Amel (Institut Pasteur de Tunis, LR11IPT02, Laboratory of Transmission, Control and Immunobiology of Infections (LTCII), Tunis, Belvedere, 1002, Tunisia) ,  Ghouila Amel (Universite Tunis El Manar, Tunis 1068, Tunisia) ,  Guerfali Fatma Z (Institut Pasteur de Tunis, LR11IPT02, Laboratory of Transmission, Control and Immunobiology of Infections (LTCII), Tunis, Belvedere, 1002, Tunisia) ,  Guerfali Fatma Z (Universite Tunis El Manar, Tunis 1068, Tunisia) ,  Atri Chiraz (Institut Pasteur de Tunis, LR11IPT02, Laboratory of Transmission, Control and Immunobiology of Infections (LTCII), Tunis, Belvedere, 1002, Tunisia) ,  Atri Chiraz (Universite Tunis El Manar, Tunis 1068, Tunisia) ,  Bali Aymen (Institut Pasteur de Tunis, LR11IPT02, Laboratory of Transmission, Control and Immunobiology of Infections (LTCII), Tunis, Belvedere, 1002, Tunisia) ,  Bali Aymen (Universite Tunis El Manar, Tunis 1068, Tunisia) ,  Attia Hanene (Institut Pasteur de Tunis, LR11IPT02, Laboratory of Transmission, Control and Immunobiology of Infections (LTCII), Tunis, Belvedere, 1002, Tunisia) ,  Attia Hanene (Universite Tunis El Manar, Tunis 1068, Tunisia) ,  Sghaier Rabiaa M. (Institut Pasteur de Tunis, LR11IPT02, Laboratory of Transmission, Control and Immunobiology of Infections (LTCII), Tunis, Belvedere, 1002, Tunisia) ,  Sghaier Rabiaa M. (Universite Tunis El Manar, Tunis 1068, Tunisia) ,  Mkannez Ghada (Institut Pasteur de Tunis, LR11IPT02, Laboratory of Transmission, Control and Immunobiology of Infections (LTCII), Tunis, Belvedere, 1002, Tunisia) ,  Mkannez Ghada (Universite Tunis El Manar, Tunis 1068, Tunisia) ,  Dickens Nicholas J. (Wellcome Trust Centre for Molecular Parasitology, Institute of Infection, Immunity and Inflammation, University of Glasgow, Sir Graeme Davies Building, 120 University Place, Glasgow G12 8TA, UK) ,  Laouini Dhafer (Institut Pasteur de Tunis, LR11IPT02, Laboratory of Transmission, Control and Immunobiology of Infections (LTCII), Tunis, Belvedere, 1002, Tunisia) ,  Laouini Dhafer (Universite Tunis El Manar, Tunis 1068, Tunisia)
資料名： Infection, Genetics and Evolution  (Infection, Genetics and Evolution)
巻： 50  ページ： 110-120  発行年： 2017年 
JST資料番号： A1228A  ISSN： 1567-1348  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Leishmania(L.)主要な寄生虫に起因する人獣共通皮膚リーシュマニア症は,チュニジアの中央部と南部の都市と郊外地域に影響を及ぼす疾患であるendemo流行する。いくつかの例は,感染は重症度の広い領域を持つL.major誘導病変によるヒト患者で報告されている。しかし,この多様性の基礎となる機構についてはほとんど知られていない。著者らの仮説は,寄生虫ゲノムの可変性は,宿主免疫学的背景に加えて,患者にみられる種内臨床変動性に寄与し,実験的モデルで観察された病変サイズの違いを説明できることである。いくつかの疫学的,in vivo及びin vitro実験に基づいて,著者らは二の臨床分離株患者およびBALB/c実験マウスモデルにおける対照的な重症度を示すに焦点を当てた。は両分離菌の間の潜在的な識別と遺伝的変異体の同定を容易にする高スループット技術としてDNAseqを使用した。著者らの結果は,様々なレベルの不均一性は染色体あるいは遺伝子コピー数変動(CNV)の両方の点で,L.major分離株の間に見出され,種内分岐が驚くほど一塩基多型(SNPs)と挿入/欠失(InDels)事象に関連していることを示した。興味あることに,特に両タイプ変異体により影響を受けた遺伝子に焦点を当て,観察された遺伝子CNVと相関していた。これらの違いは患者の重症度を説明するのに十分であるかどうかは明らかにまだ論議されが,重症度決定因子のより完全なマップを引き出すために omic情報の付加層はゲノムスクリーニングを補完するために必要であることを強く信じている。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 疫学 ,  *チュニジア共和国 ,  一塩基多型 ,  *Leishmania ,  不均一性 ,  寄生虫 ,  ゲノム ,  *ヒト ,  患者 ,  モデル ,  臨床分離菌 ,  コピー数
準シソーラス用語： *分離株 ,  *皮膚リーシュマニア症 ,  *重症度 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Leishmania major ,  人獣共通皮膚リーシュマニア症 ,  重症度 ,  臨床分離株 ,  ハイスループットゲノムスクリーニング ,  ゲノム変動

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  動物の代謝と栄養一般  (EJ02031R) ,  神経系の疾患  (GN03000O)

タイトルに関連する用語 (9件)： 対照 ,  臨床 ,  重症度 ,  ヒト ,  皮膚リーシュマニア症 ,  チュニジア ,  Leishmania ,  分離株 ,  比較ゲノミクス