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J-GLOBAL ID：201802219010008461   整理番号：18A0805782

メラニン科における葉緑体ゲノムの比較分析から推定した単子葉における動的タンデム反復【JST・京大機械翻訳】

A Dynamic Tandem Repeat in Monocotyledons Inferred from a Comparative Analysis of Chloroplast Genomes in Melanthiaceae

著者 (2件)： Do Hoang Dang Khoa (Plant Systematics Laboratory, Department of Biological Science, Gachon University) ,  Kim Joo-Hwan (Plant Systematics Laboratory, Department of Biological Science, Gachon University)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 8  ページ： 693  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 葉緑体ゲノム(cpDNA)は,それらが高度に保存され,サイズが小さく,植物において重要な役割を果たすので,被子植物の進化研究のための非常に価値のある資源である。スリップ鎖ミスパairing(SSM)は,cpDNAにおける反復単位を生成する機構であると仮定した。しかしながら,cpDNAにおける同じ領域内の異なる型の反復の蓄積を誘導するSSMイベントを介した異なる小さな反復配列の採用に関する研究は,報告されていない。本研究では,Melanthiaceaeの2つの葉緑体ゲノムを配列化し,Melanthiaceaeのゲノム事象を調べた。2つの完全なcpDNA配列の比較分析により,2つの部分的または完全な欠失があることを明らかにし,trnH_GUGからrps3の部分にわたる大きな単一コピーと逆反復領域の間の結合における潜在的分子マーカーを示した。著者らの結果は,cpDNAのrpl23-ycf2領域におけるタンデム反復の蓄積を示す。小さな保存された配列が存在し,これらの地域のさらなる観察において,Lilialesの試験された分類群の大部分にわたって,側面の縦列反復が存在している。そこで,新たに異なるタイプの反復配列を発生させる3つのシナリオを提案し,それらの結果から,SSM過程においては,SSM過程において重要な役割を果たしていることが示唆され,これらの知見は,Lilialesにおける分子マーカーをマイニングするための潜在的資源であることが示唆された。これらの知見は,SSMプロセスにおいて重要な役割を果たしている可能性がある。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *単子葉植物 ,  被子植物 ,  *ゲノム ,  反復配列
準シソーラス用語： 分類群 ,  分子マーカー ,  葉緑体DNA ,  *縦列反復配列 ,  *比較分析 ,  *葉緑体ゲノム ,  メラニン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： Xerophyllum tenax ,  Heloniopsis tubiflora ,  葉緑体ゲノム ,  タンデム反復 ,  滑り鎖の誤対合 ,  Parideae ,  メラニン科 ,  Liliales

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： メラニン ,  葉緑体ゲノム ,  比較分析 ,  推定 ,  単子葉 ,  タンデム反復