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J-GLOBAL ID：201802219238565349   整理番号：18A0024720

増幅断片長多型法を用いた高度に劣化したDNAにおける一塩基多型のスクリーニング【Powered by NICT】

Screening for single nucleotide polymorphisms in highly degraded DNA by using the amplified fragment length polymorphism technique

著者 (3件)： Machida Mitsuyo (Department of Legal Medicine, School of Medicine, Tokyo Women’s Medical University, 8-1 Kawada-cho, Shinjuku-ku, Tokyo 162-8666, Japan) ,  Taki Takashi (Department of Legal Medicine, School of Medicine, Tokyo Women’s Medical University, 8-1 Kawada-cho, Shinjuku-ku, Tokyo 162-8666, Japan) ,  Kibayashi Kazuhiko (Department of Legal Medicine, School of Medicine, Tokyo Women’s Medical University, 8-1 Kawada-cho, Shinjuku-ku, Tokyo 162-8666, Japan)
資料名： Forensic Science International: Genetics  (Forensic Science International: Genetics)
巻： 31  ページ： 5-11  発行年： 2017年 
JST資料番号： W3148A  ISSN： 1872-4973  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 短鎖縦列反復配列(STR)分析は,法医学試料のヒト同定のための一般的に用いられる;が,DNAはさまざまな環境因子により劣化されているので,標準STR解析は完全なプロファイルを生成できなかった。最近,より短いアンプリコンは分解試料に適したより良いである一塩基多型(SNP)分析は,ヒト同定のための注目を集めている。種々のSNP遺伝子座は劣化した試料の分析に使用されているが,どれがより適切な不明である。分解に耐性を示すSNPsを同定するために,著者らは,六人のボランティアの頬スワブから得られたDNAと熱処理によるK562細胞株を人工的に分解した。,増幅断片長多型(AFLP)法を用いて,SNPスクリーニングに用いた。両熱処理および未処理試料で検出されたAFLPバンドに焦点を当て,これらのバンドから抽出したDNAを直接配列決定した。熱処理の持続時間として増加したDNA分解は増加し,STRプロファイルは6hの熱処理後に発生できなかった。AFLP(増幅断片長多型バンドパターンは6時間熱処理および未処理試料間で比較した場合,八の一般的なバンドを検出した。これら共通のバンドのDNA断片の配列は,より高いアデニン-チミン(A T)含量を有し,17のSNPを含んでいた。熱処理および未処理試料中に検出されたSNPは分解に抵抗性であると考えられた。はこの研究で同定された九のSNPに関するデータベースにおける利用可能な情報は少なかったが,この研究は,これらのSNPsのいくつかは非常に分解したDNAのヒト同定に有用であることを示した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 法医学 ,  データベース ,  *DNA【核酸】 ,  *スクリーニング ,  K562細胞 ,  AFLP ,  *一塩基多型 ,  熱処理 ,  ボランティア ,  ヒト
準シソーラス用語： DNA分解 ,  ダイレクトシークエンス法 ,  スワブ ,  アンプリコン ,  短鎖縦列反復配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： 一塩基多型(SNPs) ,  分解DNA ,  増幅断片長多型(AFLP)

分類 (1件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (6件)： 増幅 ,  断片 ,  多型 ,  DNA ,  一塩基多型 ,  スクリーニング