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J-GLOBAL ID：201802219530633828   整理番号：18A0776556

<岡田孝先生・西岡孝明先生の退職記念号:化学データサイエンス>ESI-MS/MSマススペクトルの化学的注釈

[Dedicated to Prof. T. Okada and Prof. T. Nishioka: data science in chemistry]Chemical Annotation of ESI-MS/MS Spectral Data

著者 (2件)： 西岡孝明 (奈良先端科学技術大学院大学) ,  蓬莱尚幸 (茨城工業高等専門学校)
資料名： Journal of Computer Aided Chemistry (Web)  (Journal of Computer Aided Chemistry (Web))
巻： 18  ページ： 15-23(J-STAGE)  発行年： 2017年 
JST資料番号： U0067A  ISSN： 1345-8647  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 質量分析データベースMassBankには,多様な化学構造を有する有機化合物を高分解能エレクトロスプレータンデム質量分析(ESI-MS/MS)によってえられたマススペクトルが多数収集されている。このマススペクトルは,分子イオンを衝突解離することによって生成したフラグメントイオンを観察したものである。本研究では,フラグメントイオンの分子式の推定,衝突解離によって解離した分子イオンの共有結合の推定,フラグメントイオンが生成した解離経路の推定をおこなって,互いに矛盾のない信頼性の高い化学的注釈をおこなった。分子イオンがフラグメントイオンへ解離する経路の数え上げについても紹介する。これらの注釈をもとにして「フラグメントイオンと部分化学構造との関係」を獲得してMediaWikiシステムを利用したデータベースを構築し,公開している。また,この関係の部分化学構造特異性について考察する。さらにこの関係を利用して,未知化合物のマススペクトルからその化学構造に含まれる部分化学構造を推定するMetabolite predictionサービスをMassBankで提供した。(著者抄録)

シソーラス用語： *エレクトロスプレイイオン化質量分析 ,  *タンデム質量分析 ,  質量スペクトル ,  衝突誘起解離 ,  共有結合 ,  *分子構造 ,  イオン ,  *フラグメンテーション ,  性質
準シソーラス用語： *ESI-MS/MS ,  フラグメントイオン ,  化学構造 ,  特異性 ,  部分構造

著者キーワード (8件)： フラグメントイオン ,  部分化学構造の特異性 ,  解離経路の数え上げ ,  化学構造推定 ,  fragment ion ,  substructure specificity ,  dissociation sequence ,  structure prediction

分類 (2件)： 質量分析  (CC03013N) ,  質量スペクトル(分子)  (BH06100V)

引用文献 (13件)：

• NIST Home Page (URL = https://www.nist.gov /srd/nist-standard-reference-database-1a-v14)
• T. Kind, O. Fiehn, BMC Bioinformatics, 8, 105 (2007).
• F.W. McLafferty, R. Venkataraghavan, “Mass Spectral Correlations”, 2nd Ed., “Advances in Chemistry Series”, No 40, 124 pages, American Chemical Society, Washington, DC., 1982.
• H. Horai, M. Arita, S. Kanaya, Y. Nihei, T. Ikeda, K. Suwa, Y. Ojima, K. Tanaka, S. Tanaka, K. Aoshima, Y. Oda, Y. Kakazu, M. Kusano, T. Tohge, F. Matsuda, Y. Sawada, M.Y. Hirai, H. Nakanishi, K. Ikeda, N. Akimoto, T. Maoka, H. Takahashi, T. Ara, N. Sakurai, H. Suzuki, D. Shibata, S. Neumann, T. Iida, K. Funatsu, F. Matsuura, T. Soga, R. Taguchi, K. Saito, T. Nishioka, J Mass Spectrom., 45, 703-714 (2010).
• H. Horai, M. Arita, Y. Ojima1, Y. Nihei, S. Kanaya, T. Nishioka, Proceedings of German Conference in Bioinformatics (GCB'09) (GI-Edition Lecture Notes in Informatics), Halle, Germany, 173-178 (2009).

タイトルに関連する用語 (3件)： マススペクトル ,  化学 ,  注釈