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J-GLOBAL ID：201802219937538260   整理番号：18A1714060

次世代シークエンシングにより生産されたex situ evidentary土壌16S細菌プロファイルを時間的に変化させる時間【JST・京大機械翻訳】

Time Radically Alters Ex Situ Evidentiary Soil 16S Bacterial Profiles Produced Via Next-Generation Sequencing,,

著者 (3件)： Badgley Alyssa J. (Forensic Science Program, School of Criminal Justice, Michigan State University, 655 Auditorium Road, 560 Baker Hall, East Lansing, MI, 48824) ,  Jesmok Ellen M. (Forensic Science Program, School of Criminal Justice, Michigan State University, 655 Auditorium Road, 560 Baker Hall, East Lansing, MI, 48824) ,  Foran David R. (Forensic Science Program, School of Criminal Justice and Department of Integrative Biology, Michigan State University, 655 Auditorium Road, 560 Baker Hall, East Lansing, MI, 48824)
資料名： Journal of Forensic Sciences  (Journal of Forensic Sciences)
巻： 63  号： 5  ページ： 1356-1365  発行年： 2018年 
JST資料番号： T0104A  ISSN： 0022-1198  CODEN： JFSCAS  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 以前の研究は,法医目的のための土壌細菌プロファイリングの可能性を明らかにした。しかしながら,研究者は,証拠により熟成した土壌からの微生物プロファイルの変動を徹底的に調べていない。本研究において,複数の生息場所から収集した土壌を証拠項目に置き,経時的にサンプリングし,細菌プロファイルを16S rRNA遺伝子座の次世代配列決定により生成した。細菌豊度チャートと非計量多次元スケーリングプロットは細菌プロファイルの視覚的表現を時間的に提供し,一方,教師つき分類を用いてソースへの証拠を統計的に関連付けた。ex situ証拠土壌は,それらが熟成するにつれて特異的で一貫した分類学的変化を示し,多次元空間におけるドリフトをもたらしたが,異なる生息場所に向かってはいなかった。統計学的に364の同定プロファイルの95%は正しい生息場所に分類され,誤分類は一般的に証拠型からのステミングと年齢の増加を伴った。最終的に,ex situ土壌において時間的に発生する細菌変化の理解は,法医学的研究におけるそれらの使用を強化すべきである。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 土壌細菌 ,  微生物 ,  rRNA遺伝子 ,  *細菌 ,  高次元 ,  視覚 ,  生息場所 ,  統計学
準シソーラス用語： ランダムフォレスト ,  分類学 ,  教師付き分類 ,  16S rRNA ,  プロファイリング ,  *次世代シークエンシング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： 法科学 ,  土壌の証拠 ,  細菌プロファイリング ,  16S rRNA遺伝子 ,  次世代シークエンシング ,  細菌存在量チャート ,  非計量多次元スケーリング ,  教師付き分類 ,  ランダムフォレスト

分類 (1件)： 土壌生物  (FB04050N)

タイトルに関連する用語 (4件)： 次世代シークエンシング ,  土壌 ,  細菌 ,  プロファイル