MetaNetter2ab initioネットワーク解析と代謝産物特徴分類のためのCytoscapeプラグイン【Powered by NICT】

Burgess K.E.V.; Burgess K.E.V.; Borutzki Y.; Borutzki Y.; Rankin N.; Rankin N.; Daly R.; Jourdan F.

文献

J-GLOBAL ID：201802220121911987 整理番号：18A0069896

MetaNetter2ab initioネットワーク解析と代謝産物特徴分類のためのCytoscapeプラグイン【Powered by NICT】

MetaNetter 2: A Cytoscape plugin for ab initio network analysis and metabolite feature classification

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資料名：
巻： 1071 ページ： 68-74 発行年： 2017年
JST資料番号： W0571A ISSN： 1570-0232 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

メタボロミクスはしばしば高分解能質量分析データの使用に依存する。このデータの分類とフィルタリングは,イオン化と解析の際に生じる複雑な質量スペクトルアーチファクト,化学ノイズ,付加物とフラグメンテーションの過剰のために困難な課題を抱えている。さらに,検出された化合物の間の関係は,試料の性質とそれらを生じさせたことを生化学に関する豊富な情報を提供することができる。生化学的ネットワーキングツール:元MetaNetterに基づくMetaNetter2ab initioネットワークを生成するCytoscapeプラグインを提示した。新バージョンは,二種類の主要な改善:付加物ネットワークの発生と複数のサンプルに跨る地図付加物または変換パターンを表の生成を支持し,化合物関係の読出しを提供した。は二種類のクロマトグラフィーで分離された同一試料中の付加物パターンの解析にこのツールを適用し,付加物検出に及ぼす種々の緩衝液条件の影響,および単一フラグメンテーション分析と全イオンフラグメンテーションデータセットの両方に化学変換解析の応用についてに推論可能にした。最後に,生物黄色ぶどう球菌の嫌気性と好気性成長生物学的分析のためのツールの有用性を実証から得られたデータセットを解析した。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

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有機化合物の各種分析

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