文献

J-GLOBAL ID：201802220160339256   整理番号：18A1101625

バイオインフォマティクス分析による前立腺癌組織及び細胞株におけるLMNA遺伝子の第7エクソン点突然変異を分析した。【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics analysis about point mutation of exon 7 in LMNA in prostate tissues and cell lines

著者 (5件)： Zuo Lingkun (首都医科大学基礎医学院生物化学与分子生物学系,北京,100069) ,  Yang Ronghui (首都医科大学基礎医学院生物化学与分子生物学系,北京,100069) ,  Ma Hui (首都医科大学基礎医学院生物化学与分子生物学系,北京,100069) ,  Zhou Ping (首都医科大学生物医学工程学院生物医学信息学系,北京,100069) ,  Kong Lu (首都医科大学基礎医学院生物化学与分子生物学系,北京,100069)
資料名： Shoudu Yike Daxue Xuebao  (Shoudu Yike Daxue Xuebao)
巻： 38  号： 6  ページ： 884-890  発行年： 2017年 
JST資料番号： C3548A  ISSN： 1006-7795  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】前立腺癌における核フィブロネクチンA/C(laminA/C,LMNA)遺伝子の突然変異とLMNA発現の相関を調査する。【方法】正常前立腺上皮細胞(RWPE-1),低侵入性前立腺癌上皮細胞(PC-3M-2B4)および高侵入性前立腺癌上皮細胞(PC-3M-1E8)LMNA遺伝子の12のエキソンを,ハイパス配列分析によって分析した。PubMedGEOデータベースは,前立腺癌患者における点突然変異の分布を確認するために,3つのデータをダウンロードした。1番染色体で156105950から156106055の範囲を選び、配列CTACGCCTGあるいはNTACGCCTGTCCCCCAGCCCを設置する。同時に、GEOデータベースを利用して突然変異点の周辺配列の特徴と機能を分析し、最後に、突然変異プラスミドをトランスフェクションし、タンパク質電気泳動でLMNAのタンパク質発現に対する影響を分析した。【結果】すべての分析サンプルにおいて,1番染色体のLMNAエキソン7は156106006から156106011の領域にあり,2つのミスセンス突然変異パターンがあった。C/CA(p.L387LI)、C/CG(p.L387LV)と4種類の同義変異形式:前立腺癌をグリーソン(Gleasonscore,GS)採点システムによってグループ分けした。16種類の前立腺癌細胞株と5種類の前立腺良性細胞株において、ミスセンス突然変異の総発生率はそれぞれ31%と60%であった。さらに,1番染色体の156106008から156106066は転写因子結合部位であった。機能クラスター分析を通じて、これらの転写因子の機能は主にクロマチン組み換え及び調節、RNA代謝過程の正方向調節、ヒストン修飾の調節及びプログラム細胞死の負調節などに集中している。LMNAとLMNAの過剰発現は,LMNAとLMNAの蛋白質発現を下方制御した。【結語】156106006部位の突然変異は,前立腺の正常組織と前立腺の良性細胞株で多く発生し,LMNA蛋白質の発現と密接に関連する。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： クロマチン ,  染色体 ,  *突然変異 ,  *遺伝子 ,  *点突然変異 ,  ダウンレギュレーション ,  データベース ,  *前立腺腫瘍 ,  プラスミド ,  転写因子 ,  ミスセンス突然変異 ,  上皮細胞 ,  患者 ,  *前立腺
準シソーラス用語： *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： prostate cancer ,  lamin A/C (LMNA) ,  mutation ,  bioinformatics analysis

分類 (4件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  循環系の疾患  (GJ03000C) ,  泌尿生殖器の腫よう  (GM04000S)

タイトルに関連する用語 (8件)： バイオインフォマティクス ,  分析 ,  前立腺癌 ,  組織 ,  細胞株 ,  LMNA遺伝子 ,  エクソン ,  点突然変異