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J-GLOBAL ID：201802220289772731   整理番号：18A1417014

リン酸化依存的な相互作用を全プロテオーム規模で発見するために,細菌でヒトセリンホスホペプチドをコード化する

Encoding human serine phosphopeptides in bacteria for proteome-wide identification of phosphorylation-dependent interactions

著者 (9件)： BARBER Karl W (Yale Univ., Connecticut, USA) ,  ROGULINA Svetlana (Yale Univ., Connecticut, USA) ,  RINEHART Jesse (Yale Univ., Connecticut, USA) ,  MUIR Paul (Yale Univ., Connecticut, USA) ,  SZELIGOWSKI Richard V (Yale Univ., Connecticut, USA) ,  GERSTEIN Mark (Yale Univ., Connecticut, USA) ,  ISAACS Farren J (Yale Univ., Connecticut, USA) ,  SZELIGOWSKI Richard V (Southern Connecticut State Univ., Connecticut, USA) ,  SAMPSON Jeffrey R (Agilent Technol., California, USA)
資料名： Nature Biotechnology  (Nature Biotechnology)
巻： 36  号： 7  ページ： 638-644  発行年： 2018年07月06日 
JST資料番号： H0870A  ISSN： 1087-0156  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ヒトの細胞過程には翻訳後リン酸化が極めて重要であるが,この修飾には一過性で不均一であるという性質があり,天然系での研究が困難である。我々は,リン酸化,およびタンパク質間相互作用でリン酸化が果たす役割を全プロテオーム規模で調べる方法を開発した。再コード化した大腸菌でホスホセリンを遺伝的にコードし,ヒトセリンホスホプロテオームをペプチドに基づいて異種的に示した。10万個超のヒトホスホペプチドをコードする単一プラスミドライブラリーを設計し,そのうち3万6000個超でホスホセリンの部位特異的な組み込みを確認した。続いて,このホスホペプチドライブラリーをHi-Pという手法に組み入れ,セリンのリン酸化に依存するヒトタンパク質相互作用のプロテオームレベルでのスクリーニングを可能にした。Hi-Pを用いることにより,14-3-3タンパク質およびWWドメインタンパク質とホスホセリン依存的に相互作用する既知および新規と考えられる分子が数百種類発見された。これらのホスホペプチドは,全長リンタンパク質を用いるモチーフ解析およびプルダウン法から,天然のヒトホスホプロテオームの重要な結合特性を保持していることが明らかになった。この技術を用いれば,対象とするあらゆる生物,組織,または疾患で,ユーザーが規定したホスホプロテオームを調べることができる。Copyright Nature Japan KK 2018

シソーラス用語： *ペプチド ,  *リン酸化 ,  大腸菌 ,  リンタンパク質 ,  *ヒト ,  *プロテオーム ,  プラスミド ,  *相互作用 ,  プルダウンアッセイ ,  14-3-3タンパク質 ,  ホスホプロテオーム ,  蛋白質間相互作用 ,  *ホスホペプチド ,  微生物 ,  アミノ酸 ,  脂肪族アミン ,  脂肪族アルコール ,  脂肪族カルボン酸 ,  アミノアルコール ,  ヒドロキシ酸

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  生物科学研究法一般  (EA03010K)

物質索引 (2件)： ホスホセリン ,  セリン

タイトルに関連する用語 (6件)： リン酸化 ,  相互作用 ,  プロテオーム ,  規模 ,  発見 ,  細菌