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J-GLOBAL ID：201802220944664330   整理番号：18A0965631

寄生バチ攻撃に応答したDrosophilaのゲノム全体遺伝子発現における種間および種内変異【JST・京大機械翻訳】

Inter- and intra-species variation in genome-wide gene expression of Drosophila in response to parasitoid wasp attack

著者 (9件)： Salazar-Jaramillo Laura (Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Groningen, The Netherlands) ,  Salazar-Jaramillo Laura (Institute of Evolutionary Biology, The University of Edinburgh, Edinburgh, UK) ,  Jalvingh Kirsten M. (Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Groningen, The Netherlands) ,  Jalvingh Kirsten M. (Department of Ecology and Evolution, University of Lausanne, Lausanne, Switzerland) ,  Haan Ammerins de (Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Groningen, The Netherlands) ,  Haan Ammerins de (Centre for Neural Circuits and Behaviour, University of Oxford, Oxford, UK) ,  Kraaijeveld Ken (Animal Ecology, Department of Ecological Sciences, VU University Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands) ,  Buermans Henk (Leiden Genome Technology Center, Department of Human Genetics, Leiden University Medical Center, Leiden, The Netherlands) ,  Wertheim Bregje (Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences, University of Groningen, Groningen, The Netherlands)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 331  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】ショウジョウバエにおける寄生虫抵抗性は,種内および種内でかなり変化する。免疫応答,葉状体仲介カプセル化はショウジョウバエのサブクレードで進化し,その後このサブクレード内の少なくとも1種で消失した。抵抗性の機構はD.melanogasterにおいて十分に記録されているが,密接に関連する種についてはあまり知られていない。ここでは,ショウジョウバエにおける捕食寄生者攻撃後の遺伝子発現における種間および種内変異を研究した。著者らは,4つの密接に関連したDrosophila種の寄生後にRNA-seqを使用し,D.melanogasterの複製系統を,短期および長期進化変化への洞察を得るために,抵抗性を増加させるために実験的に選択した。結果:耐性レベルにかかわらず,試験した種および系統において寄生バチ攻撃後に一貫してアップレギュレートされる遺伝子のコアセットを見出した。もう一組の遺伝子はD.sechelliaにおけるアップレギュレーションまたは発現を示さず,寄生バチに対する免疫応答を高めることができなかった。このセットは,主にmelanogasterサブグループに限定された遺伝子から構成されている。人工的に選択した系統は,捕食寄生者の攻撃に対する応答において非選択系統に関して遺伝子発現に有意差を示さなかったが,いくつかの遺伝子は異なるエキソン利用を示した。結論:著者らは,4つの密接に関連したショウジョウバエ種の間で捕食寄生者攻撃に対する転写反応において,実質的な類似性を示したが,顕著な差異も示した。対照的に,D.melanogaster内では,応答は著しく類似していた。短期において,選択は免疫応答のプレ活性化に作用しないことを確認した。代わりに,それは異なるエキソン使用のような代替機構を標的とする可能性がある。長期において,著者らは,寄生者攻撃に免疫学的に抵抗する能力が,melanogasterサブグループに限定される新しい遺伝子に対して持続的であるという仮説に対する支持を見出した。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 寄生生物 ,  寄生虫 ,  *遺伝子 ,  免疫反応 ,  *遺伝子発現 ,  類似性 ,  *ショウジョウバエ ,  *寄生バチ ,  葉状体 ,  *ゲノム ,  アップレギュレーション
準シソーラス用語： 免疫学 ,  RNA-seq ,  捕食寄生者 ,  *種内変異 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： RNASEQ ,  Drosophila speciesm ,  進化免疫応答 ,  寄生バチ

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (32件)：

• BioScience; The comparative method revisited; GM Sanford, WI Lutterschmidt, VH Hutchison; 52; 2002; 830-6; 10.1641/0006-3568(2002)052[0830:TCMR]2.0.CO;2; CR1;
• Heredity; Applications of next generation sequencing in molecular ecology of non-model organisms; R Ekblom, J Galindo; 107; 2011; 1-15; 10.1038/hdy.2010.152; CR2;
• Trends Parasitol; Coevolutionary interactions between host and parasite genotypes; L Lambrechts, S Fellous, JC Koella; 22; 2006; 12-16; 10.1016/j.pt.2005.11.008; CR3;
• Ann Rev Entomol; Evolutionary ecology of insect immune defenses; P Schmid-Hempel; 50; 2005; 529-51; 10.1146/annurev.ento.50.071803.130420; CR4;
• Insect Biochem Mol Biol; Insect hemocytes and their role in immunity; MD Lavine, MR Strand; 32; 2002; 1295-309; 10.1016/S0965-1748(02)00092-9; CR5;

タイトルに関連する用語 (7件)： 寄生バチ ,  攻撃 ,  応答 ,  Drosophila ,  ゲノム ,  遺伝子発現 ,  種内変異