Markov確率場に基づく蛋白質構造の類似性/非類似性解析【JST・京大機械翻訳】

Wu Jiaqi; Zhou Tao; Tao Jin; Hai Yabing; Ye Fei; Liu Xiaoqing; Dai Qi

文献

J-GLOBAL ID：201802221651150304 整理番号：18A1136656

Markov確率場に基づく蛋白質構造の類似性/非類似性解析【JST・京大機械翻訳】

Similarity/dissimilarity analysis of protein structures based on Markov random fields

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資料名：
巻： 75 ページ： 45-53 発行年： 2018年
JST資料番号： H0201B ISSN： 1476-9271 CODEN： COCHDK 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

蛋白質構造類似性は,蛋白質と進化研究の機能的性質に関する研究において重要な役割を果たす。多くの効率的な方法が蛋白質の構造的比較を進めるために提案されているが,接触強度の定義と類似性の尺度にはまだいくつかの課題がある。本研究では,Markov確率場に基づく蛋白質構造の類似性/非類似性を解析する新しい方法を考案した。2つの実験により提案した方法を評価し,競合法と比較した。結果は,提案した方法が異なる環状ペプチドと蛋白質構造の立体配座間の類似性/非類似性を検出する強い能力を示すことを示した。α-C,酸素OおよびNは蛋白質のより保存された構造を抽出することができ,2点クリーク(V)および次数3および1のMarkov確率場は異なる蛋白質構造間の類似性/非類似性の検出においてより効率的であることも見出した。この理解は,異なる蛋白質構造の類似性/非類似性分析のためのより強力な方法を設計するために用いることができる。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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分子・遺伝情報処理 , 分子構造

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