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J-GLOBAL ID：201802221822575371   整理番号：18A1436112

2つの統計モデルを用いて,中国の肉用西門塔牛の屠殺性状の全ゲノム関連分析【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide Association Study for Carcass Traits Using Two Statistic Models in Chinese Simmental Beef Cattle

著者 (11件)： Chang Tianpeng (中国農業科学院北京畜牧獣医研究所,北京,100193) ,  Xia Jiangwei (中国農業科学院北京畜牧獣医研究所,北京,100193) ,  Bao Jinshan (内蒙古錫林郭勒盟烏拉盖管理区獣医局,烏拉盖,026321) ,  Jin Shengyun (内蒙古錫林郭勒盟烏拉盖管理区獣医局,烏拉盖,026321) ,  Zhu Bo (中国農業科学院北京畜牧獣医研究所,北京,100193) ,  Xu Lingyang (中国農業科学院北京畜牧獣医研究所,北京,100193) ,  Chen Yan (中国農業科学院北京畜牧獣医研究所,北京,100193) ,  Zhang Lupei (中国農業科学院北京畜牧獣医研究所,北京,100193) ,  Gao Xue (中国農業科学院北京畜牧獣医研究所,北京,100193) ,  Li Junya (中国農業科学院北京畜牧獣医研究所,北京,100193) ,  Gao Huijiang (中国農業科学院北京畜牧獣医研究所,北京,100193)
資料名： Xumu Shouyi Xuebao  (Xumu Shouyi Xuebao)
巻： 49  号： 4  ページ： 833-840  発行年： 2018年 
JST資料番号： C2231A  ISSN： 0366-6964  CODEN： CMHPAI  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 2種類の統計モデルを用いて、中国肉用の西門塔爾牛の体重と骨重の2つの屠殺性状について、全ゲノム関連分析(GWAS)を行い、異なるモデルの分析結果を比較した。GWASの研究を促進する。本研究では,1301頭の中国肉用シメンタール牛を試験材料とし,サンプルと表現型データを実地で採集し,測定し,サンプルDNAを抽出した。IlluminaBovineHD(770K)チップを用いて遺伝子型データを得た。線形混合モデル(LMM)と複合区間位置決定-線形混合モデル(CIM-LMM)の2つのモデルを用いて,目標形質の顕著なSNPsと候補遺伝子を同定した。2つのモデルのGWAS結果を比較し,モデルの優劣を検討した。結果、CIM-LMMはLMM検出のすべての顕著なSNPs(P<0.05)を検出し、より高い統計力を示した。本研究では、合計8と7つのSNPsは、それぞれ体重、骨重と顕著な関連があり、そのうち、2つのSNPsはこれら2つの性状とも相関した。これらのSNPsは主に3、5、6、10、14、16、17番染色体に分布し、そのうち6号と14号染色体の顕著なSNPs分布は比較的集中していた。最終的に,11の候補遺伝子を発見し,GCNT4,ALDH1A2,LCORL,およびWDFY3遺伝子の機能を検討した。本研究は中国の肉用の西門塔爾牛の屠殺性状の遺伝メカニズムについて探求し、そしてGWASの研究方法に新たな構想を開拓した。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *統計模型 ,  一塩基多型 ,  *屠殺 ,  体重 ,  遺伝子 ,  DNA【核酸】 ,  位置決め ,  遺伝 ,  表現型 ,  遺伝子型 ,  *ゲノム ,  *塔状構造物 ,  染色体 ,  ゲノムワイド関連解析
準シソーラス用語： 候補遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： LMM ,  CIM ,  GWAS ,  carcass weight ,  bone weight ,  Chinese Simmental beef cattle

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  豚  (FD02040U)

タイトルに関連する用語 (8件)： 統計モデル ,  中国 ,  肉 ,  牛 ,  屠殺 ,  性状 ,  ゲノム ,  分析