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J-GLOBAL ID：201802222633455134   整理番号：18A1005908

RAD-seqを用いた一般的なキジ(Phasianus colchicus)のための新規マイクロサテライトマーカーの開発と特性化【JST・京大機械翻訳】

Development and characterization of novel microsatellite markers for the Common Pheasant ( Phasianus colchicus ) using RAD-seq

著者 (6件)： Wang Biao (State Key Laboratory of Biocontrol, College of Ecology and Evolution/School of Life Sciences, Sun Yat-sen University, Guangzhou, China) ,  Xie Xuan (State Key Laboratory of Biocontrol, College of Ecology and Evolution/School of Life Sciences, Sun Yat-sen University, Guangzhou, China) ,  Liu Simin (State Key Laboratory of Biocontrol, College of Ecology and Evolution/School of Life Sciences, Sun Yat-sen University, Guangzhou, China) ,  Wang Xuejing (State Key Laboratory of Biocontrol, College of Ecology and Evolution/School of Life Sciences, Sun Yat-sen University, Guangzhou, China) ,  Pang Hong (State Key Laboratory of Biocontrol, College of Ecology and Evolution/School of Life Sciences, Sun Yat-sen University, Guangzhou, China) ,  Liu Yang (State Key Laboratory of Biocontrol, College of Ecology and Evolution/School of Life Sciences, Sun Yat-sen University, Guangzhou, China)
資料名： Avian Research (Web)  (Avian Research (Web))
巻： 8  号： 1  ページ： 4  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7360A  ISSN： 2053-7166  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】Common Pheasant(Phasianus colchicus)Linnaeus,1758は世界で最も広く知られており,ゲーム鳥類として広く紹介されている。野生および捕獲個体群の保存遺伝学および管理に対する必要性の増加は,遺伝子型個体および個体群に対する多形性マイクロサテライトのような永続的遺伝資源を必要とする。【方法】本研究において,Common Pheasantのための7598の新規多形性マイクロサテライトを,Illuminaハイスループット配列プラットフォームにおいてRAD-Seqアプローチを用いて分離した。ニワトリゲノムからの10の新規マイクロサテライトと3つの既存のもののパネルを多重化し,Common Pheasant(各々9亜種と10個体を代表する)の90個体とGreen Pheasant(P.versicolor)の10個体のセットについて遺伝子型を決定した。【結果】これらの13のマイクロサテライトは,2から8までの範囲の遺伝子座あたりの対立遺伝子の数および0.049から0.905までの期待されたヘテロ接合性を有する中程度から高レベルの多型を示した。STRUCTUREで実行されたBayesクラスタ化手法を用いた亜種/個体群の遺伝的構造の最初の解析は,GreenとCommon Pheasantの両方に対応する2つの遺伝的クラスターを示し,Common Pheasant内のサブ集団構造化のさらなる証拠を示した。【結論】これらのマーカーは,これらの2つのPhasianus pheeasおよびおそらく他の密接に関連したゲーム鳥類における持続可能な使用および進化研究のための有用な遺伝的ツールである。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： クラスタ化 ,  多重化 ,  クラスタ ,  遺伝 ,  遺伝学 ,  個体群 ,  捕獲 ,  *キャラクタリゼーション ,  遺伝子型 ,  遺伝資源 ,  対立遺伝子 ,  *マイクロサテライト ,  ゲーム
準シソーラス用語： 亜種 ,  *マイクロサテライトマーカー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 人口構造 ,  ゲームの鳥 ,  再生産 ,  RAD-seq ,  ハイブリダイゼーション

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  集団遺伝学  (EC01040J)

引用文献 (32件)：

• PLoS ONE; Rapid SNP discovery and genetic mapping using sequenced RAD markers; NA Baird, PD Etter, TS Atwood, MC Currey, AL Shiver, ZA Lewis, EU Selker, WA Cresko, EA Johnson; 3; 2008; e3376; 10.1371/journal.pone.0003376; CR1;
• Anim Genet; Polymorphic microsatellites developed by cross-species amplifications in common pheasant breeds; M Baratti, A Alberti, M Groenen, T Veenendaal, FD Fulgheri; 32; 2001; 222-225; 10.1046/j.1365-2052.2001.00767.x; CR2;
• Am J Hum Genet; Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms; D Botstein, RL White, M Skolnick, RW Davis; 32; 1980; 314-331; CR3;
• Int J Galliformes Conserv; The subspecies of the common pheasant Phasianus colchicus in the wild and captivity; T Braasch, T Pes, S Michel, H Jacken; 2; 2011; 6-13; CR4;
• Conserv Genet Resour; Development of nineteen polymorphic microsatellite loci in the threatened polar bear (Ursus maritimus) using next generation sequencing; JR Brandt, P Groot, K Zhao, MG Dyck, PT Boag, AL Roca; 6; 2014; 59-61; 10.1007/s12686-013-0003-9; CR5;

タイトルに関連する用語 (5件)： RAD-seq ,  キジ ,  マイクロサテライトマーカー ,  開発 ,  特性化