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J-GLOBAL ID：201802223052463180   整理番号：18A0354974

ひ臓のトランスクリプトームプロファイリングはポリ(I: C)チャレンジ後のSchizothorax prenantiにおける抗ウイルス機構への洞察を提供する【Powered by NICT】

Transcriptome profiling of spleen provides insights into the antiviral mechanism in Schizothorax prenanti after poly (I: C) challenge

著者 (13件)： Du Xiaogang (Department of Engineering and Applied Biology, College of Life Science, Sichuan Agricultural University, Ya’an 625014, Sichuan, China) ,  Li Yunkun (Department of Engineering and Applied Biology, College of Life Science, Sichuan Agricultural University, Ya’an 625014, Sichuan, China) ,  Li Dong (Department of Engineering and Applied Biology, College of Life Science, Sichuan Agricultural University, Ya’an 625014, Sichuan, China) ,  Lian Fangliang (Department of Engineering and Applied Biology, College of Life Science, Sichuan Agricultural University, Ya’an 625014, Sichuan, China) ,  Yang Shiyong (Department of Aquaculture, Sichuan Agricultural University, 625014, Sichuan, China) ,  Wu Jiayun (Department of Zoology, Sichuan Agricultural University, 625014, Sichuan, China) ,  Liu Hanmei (Department of Engineering and Applied Biology, College of Life Science, Sichuan Agricultural University, Ya’an 625014, Sichuan, China) ,  Bu Guixian (Department of Engineering and Applied Biology, College of Life Science, Sichuan Agricultural University, Ya’an 625014, Sichuan, China) ,  Meng Fengyan (Department of Engineering and Applied Biology, College of Life Science, Sichuan Agricultural University, Ya’an 625014, Sichuan, China) ,  Cao Xiaohan (Department of Engineering and Applied Biology, College of Life Science, Sichuan Agricultural University, Ya’an 625014, Sichuan, China) ,  Zeng Xianyin (Department of Engineering and Applied Biology, College of Life Science, Sichuan Agricultural University, Ya’an 625014, Sichuan, China) ,  Zhang Huaiyu (Department of Engineering and Applied Biology, College of Life Science, Sichuan Agricultural University, Ya’an 625014, Sichuan, China) ,  Chen Zhiyu (Department of Engineering and Applied Biology, College of Life Science, Sichuan Agricultural University, Ya’an 625014, Sichuan, China)
資料名： Fish & Shellfish Immunology  (Fish & Shellfish Immunology)
巻： 62  ページ： 13-23  発行年： 2017年 
JST資料番号： W1617A  ISSN： 1050-4648  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Schizothorax prenanti(S.prenanti)は中国南西部における重要な経済的な冷水魚種であるが,種々の病原体感染の影響を受けやすい。抗ウイルス機構を明らかにするために,本研究では,著者らは,次世代配列解析技術(RNA-seq)を用いたウイルス類似体,ポリ(I:C)(pIC),による攻撃後のS.prenanti脾臓のトランスクリプトームを解析した。12時間でひ臓における313の差別的発現遺伝子(DEG)をpIC処理,268有意にアップレギュレーションされユニジーン(倍変化>2)と45ユニジーンの有意にダウンレギュレートされた(倍変化>2)を含む後に得られた。免疫関連DEG(IRD)スクリーニングにより,47IRDはヒートマップ,pIC処理後有意差を示した直感を確立するために用いた。RNA-seqデータを検証し,遺伝子発現を観察するために,14IRDの発現レベルは0 4 8 12,及び24でpIC処理後のqPCRにより検出した。結果はqPCRデータは,RNA-seqデータと正の線形相関を示し,14IRDは,IL-1βを除いてpIC刺激に応答したことを示した。,RNA-seqとqPCRデータに基づいて,MDA5およびJak仲介シグナル伝達経路は抗ウイルスシグナル伝達に関与し,ブロックウイルス侵入に対するI型IFNとISGをそれぞれ誘起するかもしれないことを示した。残念なことに,ウイルスdsRNAの受容体として,TLR3とTLR22は本研究において著明に発現されなかった。それにもかかわらず,著者らの研究は,さらに免疫学的研究のための抗ウイルス免疫の有用なmRNA配列を提供し,S.prenantiにおける疾患制限を改善する容易にした。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  スクリーニング ,  中華人民共和国 ,  感染 ,  二本鎖RNA ,  定量的PCR法 ,  mRNA ,  *トランスクリプトーム ,  病原体 ,  アップレギュレーション ,  *ウイルス ,  *脾臓 ,  遺伝子発現 ,  受容体
準シソーラス用語： MDA5 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： トランスクリプトーム ,  Schizothorax prenanti ,  ポリ(I:C) ,  微分発現遺伝子 ,  ひ臓 ,  qPCR

分類 (4件)： 生体防御と免疫系一般  (ED01010F) ,  感染免疫  (ED03030P) ,  魚類以外の水産動物  (FH02030V) ,  増養殖の技術  (FH04020Y)

タイトルに関連する用語 (4件)： ひ臓 ,  Schizothorax ,  ウイルス ,  洞察