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J-GLOBAL ID：201802223594285311   整理番号：18A1812403

野生,家畜化および野生のEinkorn遺伝子型を含む高分解能Einkorn(Triticum monococcum L.)連鎖地図【JST・京大機械翻訳】

A high-resolution einkorn (Triticum monococcum L.) linkage map involving wild, domesticated and feral einkorn genotypes

著者 (4件)： Marino Rosanna (CREA - Research Centre for Animal Production and Aquaculture, S. Angelo Lodigiano (LO), Italy) ,  Volante Andrea (CREA - Research Centre for Animal Production and Aquaculture, S. Angelo Lodigiano (LO), Italy) ,  Brandolini Andrea (CREA - Research Centre for Animal Production and Aquaculture, S. Angelo Lodigiano (LO), Italy) ,  Heun Manfred (Faculty of Environmental Sciences and Natural Resource Management (MINA), Norwegian University of Life Sciences (NMBU), Ås, Norway)
資料名： Plant Breeding  (Plant Breeding)
巻： 137  号： 5  ページ： 682-690  発行年： 2018年 
JST資料番号： B0357A  ISSN： 0179-9541  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Triticum monococcumの高分解能コンセンサス連鎖地図を,栽培,野生および野生のeinkornコムギ系統を含む2つの別々の地図から組み立てた。DArTseqマーカーに基づく遺伝子タイピング(GBS)アプローチにより,過剰伸長マップが得られた。欠落したデータによりすべてのマーカーを削除し,それから二重のシングルトンを欠落データに変換することにより,公表されたゲノムサイズに近い約1,380cMの2つのマップを生成した。コンセンサス地図は1,562cMに及び,1つのビンが0.92cMごとにマップされ,1つのギャップ>10cMを示した。染色体長は151cM(染色体4)と270cM(染色体7)の間で変化した。コンセンサスマップを他のAゲノムマップと比較し,遺伝的にマッピングしたDArTseqの配列を用いて,共直線性を評価し,パンコムギAゲノムの7つの染色体にマップ化マーカーを割り当てる配列相同性に基づいてT.monococcum,T.urartu及びT.aestivumドラフトゲノムのコンティグを固定した。最後に,配列のin silico機能特性化を行った。この高分解能マップはQTLと関連分析を容易にし,einkornゲノムのゲノム集合を支援する。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *高分解能 ,  染色体 ,  *遺伝子型 ,  コムギ ,  配列相同性 ,  ゲノム ,  *連鎖地図 ,  *遺伝
準シソーラス用語： in silico ,  コンティグ ,  パンコムギ ,  遺伝子タイピング ,  DArT ,  *Triticum monococcum ,  *家畜化 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： DARTseq ,  Einkorn ,  遺伝子型決定法 ,  分子地図 ,  シングルトン

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  麦  (FC03033M)

タイトルに関連する用語 (5件)： 家畜化 ,  遺伝子型 ,  高分解能 ,  Triticum ,  連鎖地図