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J-GLOBAL ID：201802224402904388   整理番号：18A0725295

欲張り欲な投影距離相関に基づく複雑なイメージング遺伝学関連の高速で正確な検出【JST・京大機械翻訳】

Fast and Accurate Detection of Complex Imaging Genetics Associations Based on Greedy Projected Distance Correlation

著者 (7件)： Fang Jian (Department of Biomedical Engineering, Tulane University, New Orleans, LA, USA) ,  Xu Chao (Department of Biostatistics and Bioinformatics, Tulane University, New Orleans, LA, USA) ,  Zille Pascal (Department of Biomedical Engineering, Tulane University, New Orleans, LA, USA) ,  Lin Dongdong (The Department of Electrical and Computer Engineering, The Mind Research Networks, The University of New Mexico, Albuquerque, NM, USA) ,  Deng Hong-Wen (Department of Biostatistics and Bioinformatics, Tulane University, New Orleans, LA, USA) ,  Calhoun Vince D. (The Department of Electrical and Computer Engineering, The Mind Research Networks, The University of New Mexico, Albuquerque, NM, USA) ,  Wang Yu-Ping (Department of Biomedical Engineering, Tulane University, New Orleans, LA, USA)
資料名： IEEE Transactions on Medical Imaging  (IEEE Transactions on Medical Imaging)
巻： 37  号： 4  ページ： 860-870  発行年： 2018年 
JST資料番号： H0895A  ISSN： 0278-0062  CODEN： ITMID4  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 画像遺伝学における最近の進歩は,機能的MRI画像,一塩基多型(SNP),および認知評価を含む大量のデータを生成する。これらの不均一および相補的データ間の複雑な相互作用を理解することは,精神疾患の診断および予防に役立つ可能性がある。しかし,これらのデータの高次元性,グループ構造および混合型により,限られた努力がなされている。本論文では,画像遺伝学データ間の条件付き相関を検出するための新しい方法を提案した。投影距離相関を用いて,高次元混合データ間の条件付き依存性グラフを構築し,次に,多重試験を用いて,有意なグループレベルの関連(例えば,内部遺伝子の領域)を検出した。さらに,直交gre欲アルゴリズムに基づくスケーラブルなアルゴリズムを導入し,欲張り投影距離相関(G-PDC)を得た。これにより計算コストを低減することができ,大量の画像化ゲノミクスデータの解析に重要である。シミュレーションからの結果は,特に相関が非線形であるとき,距離相関,ピアソンの相関,および部分相関よりもG-PDCによる高い精度を実証した。最後に,fMRI画像とSNPプロファイルを含む866のサンプルを用いて,著者らの方法をPhiadelphia Neuro発生データコホートに適用した。結果は,いくつかの統計的に有意で生物学的に興味ある相互作用を明らかにし,多くの既存の研究でさらに検証されている。MATLABコードは,https:/sies.google.comm/サイト/jiang86/gPDCで利用可能である。Copyright 2018 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 一塩基多型 ,  遺伝子 ,  直交性 ,  アルゴリズム ,  精神病 ,  画像 ,  *遺伝学 ,  相互作用 ,  多重化 ,  *画像処理 ,  高次元
準シソーラス用語： MATLAB ,  計算コスト ,  集団構造 ,  機能的MRI , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 医用画像処理  (JE04020T)

タイトルに関連する用語 (4件)： 投影 ,  相関 ,  イメージング ,  遺伝学