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J-GLOBAL ID：201802224919145024   整理番号：18A0683526

ヤクにおけるmiR-101の標的遺伝子予測および生物情報学的解析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatic Analysis and Prediction of miRNA-101 Target Genes in Yak

著者 (8件)： Ling Xiaoxiao (中国農業科学院蘭州畜牧与獣薬研究所,蘭州730050;甘粛省mao牛繁育重点実験室,蘭州730050) ,  Wu Xiaoyun (中国農業科学院蘭州畜牧与獣薬研究所,蘭州730050;甘粛省mao牛繁育重点実験室,蘭州730050) ,  Liang Chunnian (中国農業科学院蘭州畜牧与獣薬研究所,蘭州730050;甘粛省mao牛繁育重点実験室,蘭州730050) ,  Tang Peng (甘粛省mao牛繁育重点実験室,蘭州730050;甘粛農業大学,蘭州730050) ,  Wang Hongbo (中国農業科学院蘭州畜牧与獣薬研究所,蘭州730050;甘粛省mao牛繁育重点実験室,蘭州730050) ,  Bao Pengjia (中国農業科学院蘭州畜牧与獣薬研究所,蘭州730050;甘粛省mao牛繁育重点実験室,蘭州730050) ,  Guo Xian (中国農業科学院蘭州畜牧与獣薬研究所,蘭州730050;甘粛省mao牛繁育重点実験室,蘭州730050) ,  Yan Ping (中国農業科学院蘭州畜牧与獣薬研究所,蘭州730050;甘粛省mao牛繁育重点実験室,蘭州730050)
資料名： Zhongguo Xumu Shouyi  (Zhongguo Xumu Shouyi)
巻： 44  号： 9  ページ： 2580-2586  発行年： 2017年 
JST資料番号： C3580A  ISSN： 1671-7236  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究では、関連生物情報学ソフトとデータベースを用いて、ヤクのmiR-101に対して標的遺伝子予測と生物情報学分析を行った。ヤクのmiR-101の配列を高スループット配列決定によって得て,配列の保存性を分析した;そして,それらの配列は保存されていることが示された。TargetScan、miRanda、PicTarの予測結果の交差集合を選び、miRTarbaseによって実証された標的遺伝子の集合を結合し、BINGOとDAVIDデータベースを用いて、標的遺伝子集合のオントロジー注釈を獲得した。GOの機能濃縮とPathway信号経路の濃縮分析を行った。結果は,miR-101配列が種々の種間で高度に保存されていることを示した。miR-101により調節される標的遺伝子GOの機能的蓄積は主に多細胞生物体の発育、発育過程、系統発育、解剖構造の発育、器官発育などの基本生物学的過程とタンパク質の結合、転写因子活性などの分子機能を含む。標的遺伝子は細胞の各成分に存在し、細胞質、細胞核、細胞器中に含まれている。信号伝達経路はMAPKシグナル伝達経路(MAPK signaling pathway)、接着斑(focal adhesion)、ErbBシグナル伝達経路(ErbB signaling pathway)、Wntシグナル伝達経路(TGF-beta signaling pathway)、mTORシグナル伝達経路(mTOR signaling pathway)に顕著に富む(P<0.05)。ヤクにおけるmiR-101標的遺伝子の生物情報学的分析により、ヤクの筋肉発育におけるmiR-101の作用について更なる研究を行うために基礎を築いた。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： オントロジー ,  アノテーション ,  転写因子 ,  細胞質 ,  細胞核 ,  解剖 ,  データベース ,  タンパク質 ,  *予測
準シソーラス用語： Wntシグナル ,  ErbB ,  生物学的過程 ,  ハイスループット ,  *バイオインフォマティクス ,  *標的遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： yak ,  miR-101 ,  target genes ,  bioinformatics

分類 (3件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (5件)： ヤク ,  標的遺伝子 ,  予測 ,  生物情報学 ,  解析