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J-GLOBAL ID：201802225316556391   整理番号：18A0333194

MIRU-VNTR遺伝子タイピングにより検出されたウシのMycobacterium avium亜種paratuberculosis分離株の低い遺伝的多様性【Powered by NICT】

Low genetic diversity of bovine Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis isolates detected by MIRU-VNTR genotyping

著者 (6件)： de Kruijf Marcel (Cork Institute of Technology, Department of Biological Sciences, Rossa Avenue, Bishopstown, Cork, Ireland) ,  Lesniak Olga N. (Cork Institute of Technology, Department of Biological Sciences, Rossa Avenue, Bishopstown, Cork, Ireland) ,  Yearsley Dermot (Central Veterinary Research Laboratory, Department of Agriculture, Food and the Marine, Backweston, Celbridge, Kildare, Ireland) ,  Ramovic Elvira (Central Veterinary Research Laboratory, Department of Agriculture, Food and the Marine, Backweston, Celbridge, Kildare, Ireland) ,  Coffey Aidan (Cork Institute of Technology, Department of Biological Sciences, Rossa Avenue, Bishopstown, Cork, Ireland) ,  O’Mahony Jim (Cork Institute of Technology, Department of Biological Sciences, Rossa Avenue, Bishopstown, Cork, Ireland)
資料名： Veterinary Microbiology  (Veterinary Microbiology)
巻： 203  ページ： 280-285  発行年： 2017年 
JST資料番号： A1255A  ISSN： 0378-1135  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： マイコバクテリア散在反復単位と可変数縦列反復配列(MIRU VNTR)はMycobacterium avium亜種paratuberculosis(MAP)分離株を区別するための簡単,迅速かつコスト効率的な分子タイピング法として開発された。本研究の目的は,MAP分離株の大規模コレクションにおけるMIRU-VNTRタイピング法を利用して,アイルランド共和国を横断するMAPのゲノム多様性を決定することであった。アイルランド共和国の19郡で53群に由来する114MAP株は八確立されたMIRU-VNTR遺伝子座に基づく遺伝子型を決定した。四INMV基は本研究中に観察された。INMV1は67MAP株(58.8%)で見出され,INMV2は45株(39.4%)で観察された。INMV3とINMV116は各1株のみを記録した(0.9%)。ユニークなINMV116群はこれまで群間の報告されていないとINMV116に分類されるMAP分離株の分子パターンが観察され他の三INMV群と比較してMIRU-VNTR X3遺伝子座における差を示した。INMV1INMV2とINMV3はヨーロッパで頻繁に観察され,この研究で特性化した全MAP分離株の99.1%を占め,MAPはMIRU-VNTR法を用いたアイルランド共和国を横断する低レベルの遺伝的多様性を示したことを示した。追加タイピング法としてSNP解析またはMLSSRを実施することで,MAP遺伝的多様性を増加させるであろう。INMV3はユニークであるアイルランドに一方INMV116は以前にMIRU-VNTRタイピングにより群間の報告されていない。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： キャラクタリゼーション ,  *Mycobacterium ,  ゲノム ,  遺伝子 ,  アイルランド ,  遺伝子型
準シソーラス用語： SNP解析 ,  *タイピング ,  分子タイピング ,  縦列反復配列 ,  *遺伝多様性 ,  *分離株 ,  *亜種 ,  *遺伝子タイピング ,  *VNTR , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： マイコバクテリアの散在性反復ユニットと可変数縦列反復(MIRU VNTR) ,  Mycobacterium avium亜種paratuberculosis ,  ヨーネ病 ,  遺伝子 ,  アイルランド

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  微生物検査法  (EG02020G) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

タイトルに関連する用語 (7件)： VNTR ,  遺伝子タイピング ,  ウシ ,  Mycobacterium ,  亜種 ,  分離株 ,  遺伝的多様性