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J-GLOBAL ID：201802225357170391   整理番号：18A1197009

慢性閉塞性肺疾患患者の末梢血単核細胞におけるマイクロRNAおよびmRNA調節の生物情報学的解析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatic analysis of microRNA and mRNA Regulation in peripheral blood mononuclear cells of patients with chronic obstructive pulmonary disease

著者 (10件)： Dang Xiaomin (Department of Respiration, The First Affiliated Hospital, Xi’an Jiaotong University, Xi’an, China) ,  Qu Xiaoyan (Center for Translational Medicine, The Key Laboratory of Biomedical Information Engineering of Ministry of Education, School of Life Science and Technology and Frontier Institute of Science and Technology, Xi’an Jiaotong University, Xi’an, China) ,  Wang Weijia (Center for Translational Medicine, The Key Laboratory of Biomedical Information Engineering of Ministry of Education, School of Life Science and Technology and Frontier Institute of Science and Technology, Xi’an Jiaotong University, Xi’an, China) ,  Liao Chongbing (Center for Translational Medicine, The Key Laboratory of Biomedical Information Engineering of Ministry of Education, School of Life Science and Technology and Frontier Institute of Science and Technology, Xi’an Jiaotong University, Xi’an, China) ,  Li Ying (Center for Translational Medicine, The Key Laboratory of Biomedical Information Engineering of Ministry of Education, School of Life Science and Technology and Frontier Institute of Science and Technology, Xi’an Jiaotong University, Xi’an, China) ,  Zhang Xiaojin (Center for Translational Medicine, The Key Laboratory of Biomedical Information Engineering of Ministry of Education, School of Life Science and Technology and Frontier Institute of Science and Technology, Xi’an Jiaotong University, Xi’an, China) ,  Xu Dan (Center for Translational Medicine, The Key Laboratory of Biomedical Information Engineering of Ministry of Education, School of Life Science and Technology and Frontier Institute of Science and Technology, Xi’an Jiaotong University, Xi’an, China) ,  Baglole Carolyn J. (Meakins-Christie Laboratories and Respiratory Division, Health Centre and Department of Medicine, McGill University, Montreal, Canada) ,  Shang Dong (Department of Respiration, The First Affiliated Hospital, Xi’an Jiaotong University, Xi’an, China) ,  Chang Ying (Center for Translational Medicine, The Key Laboratory of Biomedical Information Engineering of Ministry of Education, School of Life Science and Technology and Frontier Institute of Science and Technology, Xi’an Jiaotong University, Xi’an, China)
資料名： Respiratory Research (Web)  (Respiratory Research (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 4  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7545A  ISSN： 1465-993X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:慢性閉塞性肺疾患(COPD)は,単球,リンパ球および好中球の増加した動員により典型化される進行性,不可逆性慢性炎症性疾患である。これにより,末梢血核細胞(PBMC)評価の利便性だけでなく,PBMCのmiRNAプロファイリングは,様々な疾患に対して近年注目を集めている。そこで,著者らはmiRNAとmRNAプロファイルを分析し,COPD被験者対喫煙者間のそれらの調節ネットワークを,気流制限なしで理解した。【方法】プールされた17人の喫煙者および14人のCOPD被験者からのPBMCのmiRNAおよびmRNAプロファイリングを,ハイスループットマイクロアレイによって検出した。調節不全miRNAの発現を,q-PCRにより検証した。調節不全mRNAにおけるmiRNA標的を予測し,経路濃縮を分析した。【結果】miRNAマイクロアレイは,喫煙者と比較してCOPD被験者において8つのmiRNAが上方制御され,3つのmiRNAが下方制御されたことを示した。miR-24-3p,miR-93-5p,miR-320aおよびmiR-320bのアップレギュレーションおよびmiR-1273g-3pのダウンレギュレーションを,次に検証した。miRNAとmRNAの間の調節ネットワークの生物情報学的分析は,NODとTLRが最も濃縮された経路であることを示した。miR-24-3pはIL-18,IL-1β,TNF,CCL3およびCCL4およびmiR-93-5pを調節し,IκBαを調節すると予測された。結論:miRNAとmRNAの発現は,気流制限のない喫煙者と比較してCOPD患者のPBMCsで調節された。調節不全miRNAとmRNAの間の調節ネットワークは,COPDのための潜在的治療標的を提供する可能性がある。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *患者 ,  *mRNA ,  *末梢血 ,  好中球 ,  単球 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  リンパ球
準シソーラス用語： マイクロアレイ ,  miR-93 ,  喫煙者 ,  プロファイリング ,  *バイオインフォマティクス ,  *マイクロRNA ,  *末梢血単核細胞 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： miRNA ,  COPD ,  PBMC ,  マイクロアレイ ,  マイクロRNA

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (43件)：

• Lancet; Burden and clinical features of chronic obstructive pulmonary disease (COPD); RA Pauwels, KF Rabe; 364; 2004; 613-20; 10.1016/S0140-6736(04)16855-4; CR1;
• Chest; Inflammation of the airways and lung parenchyma in COPD: role of T cells; MG Cosio, J Majo, MG Cosio; 121; 2002; 160S-5S; 10.1378/chest.121.5_suppl.160S; CR2;
• Mediators Inflamm; Cellular and cytokine immunoregulation in patients with chronic obstructive pulmonary disease and bronchial asthma; W Stankiewicz, MP Dabrowski, A Chcialowski, T Plusa; 11; 2002; 307-12; 10.1080/09629350210000015719; CR3;
• N Engl J Med; Immunologic aspects of chronic obstructive pulmonary disease; MG Cosio, M Saetta, A Agusti; 360; 2009; 2445-54; 10.1056/NEJMra0804752; CR4;
• Cell; MicroRNAs: target recognition and regulatory functions; DP Bartel; 136; 2009; 215-33; 10.1016/j.cell.2009.01.002; CR5;

タイトルに関連する用語 (8件)： 慢性閉塞性肺疾患 ,  患者 ,  末梢血単核細胞 ,  マイクロRNA ,  mRNA ,  調節 ,  生物情報学 ,  解析