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J-GLOBAL ID：201802225365147124   整理番号：18A1293362

Mycobacterium kansasiiの迅速識別とサブタイピングのためのMALDIスペクトルデータベース【JST・京大機械翻訳】

MALDI Spectra Database for Rapid Discrimination and Subtyping of Mycobacterium kansasii

著者 (11件)： Murugaiyan Jayaseelan (Centre for Infectious Medicine, Institute of Animal Hygiene and Environmental Health, Freie Universitaet Berlin) ,  Lewin Astrid (Division 16, Mycotic and Parasitic Agents and Mycobacteria, Robert Koch Institute) ,  Kamal Elisabeth (Division 16, Mycotic and Parasitic Agents and Mycobacteria, Robert Koch Institute) ,  Bakula Zofia (Department of Applied Microbiology, Faculty of Biology, Institute of Microbiology, University of Warsaw) ,  van Ingen Jakko (Department of Medical Microbiology, Radboud University Medical Center) ,  Ulmann Vit (Institute of Public Health) ,  Unzaga Baranano Miren J. (Clinical Microbiology and Infection Control, Basurto Hospital) ,  Humiecka Joanna (Hospital for Infectious Diseases in Warsaw, Medical University of Warsaw) ,  Safianowska Aleksandra (Department of Internal Medicine, Pulmonology, and Allergology, Medical University of Warsaw) ,  Roesler Uwe H. (Centre for Infectious Medicine, Institute of Animal Hygiene and Environmental Health, Freie Universitaet Berlin) ,  Jagielski Tomasz (Department of Applied Microbiology, Faculty of Biology, Institute of Microbiology, University of Warsaw)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 9  ページ： 587  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Mycobacterium kansasiiは,重篤な肺疾患を引き起こすことができる新興の非結核性マイコバクテリア(NTM)病原体である。7つの現在認識されているM.kansasii遺伝子型(I-VII),遺伝子型IおよびIIは最も一般的であり,ヒト疾患と関連しているが,他の5つ(III-VII)遺伝子型は主に環境起源であり,非病原性であると信じられている。M.kansasiiのサブタイピングは,診断を追求し,適切なタイムリーな治療を開始するための臨床医を導くための価値あるツールとして役立つ。マトリックス支援レーザ脱離/イオン化飛行時間型質量分析(MALDI-TOF MS)技術を用いたマイコバクテリアの以前の迅速診断試験の大部分は,種レベル同定に焦点を合わせた。本研究の目的は,遺伝子型レベルでのM.kansasiiの識別のためのMALDI-TOF MS参照スペクトルデータベースを確立することであった。M.kansasii遺伝子型I-VIの代表である32株のパネルを選択し,全細胞蛋白質を抽出し,MALDI-TOF MSで測定した。ユニークな主スペクトル(MSP)ライブラリーを,MALDI Biotyper Compass Exプローerソフトウェアを用いて作成した。スペクトル再現性を,複合相関指数とMSP交差マッチングを計算することによって評価した。データベースの試験に用いた100の臨床的M.kansasii分離株は,遺伝子レベルで90%の同定をもたらし,種レベルで7%の同定と2%の同定がログスコア値1.7の閾値以下であり,それらのすべてが遺伝子型レベルで正しかった。1株は同定できなかった。一方,37%の株は種レベルで同定され,40%は属レベルで,23%は生産者のデータベースで同定されなかった。MALDI-TOF MSは,M.kansasii遺伝子型間を検出し識別するための迅速でロバストなツールであることが証明された。MALDI-TOF MSはM.kansasiiと他のNTM種のルーチン診断ワークフローに組み込まれる可能性があると結論した。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： タンパク質 ,  再現性 ,  *スペクトル ,  病原体 ,  ソフトウェア ,  生産者 ,  ロバスト性 ,  遺伝子 ,  遺伝子型 ,  質量分析 ,  *Mycobacterium ,  マッチング ,  MALDI-TOF MS ,  *データベース
準シソーラス用語： *Mycobacterium kansasii , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： バイオタイプ ,  マトリックス支援レーザ脱離イオン化-飛行時間質量分析 ,  マイクロフレックス ,  Mycobacterium kansasii ,  遺伝子型

分類 (2件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  質量分析  (CC03013N)

タイトルに関連する用語 (6件)： Mycobacterium ,  識別 ,  サブ ,  タイピング ,  スペクトル ,  データベース