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J-GLOBAL ID：201802225394944708   整理番号：18A0786894

HIV進行はエンベロープ蛋白質のコドンおよびアミノ酸使用プロファイルに依存し,宿主-遺伝的影響を関連する【JST・京大機械翻訳】

HIV Progression Depends on Codon and Amino Acid Usage Profile of Envelope Protein and Associated Host-Genetic Influence

著者 (4件)： Roy Ayan (Department of Botany, Bioinformatics Facility, University of North Bengal) ,  Banerjee Rachana (Structural Biology and Bio-Informatics Division, CSIR-Indian Institute of Chemical Biology) ,  Basak Surajit (Department of Molecular Biology and Bioinformatics, Tripura University) ,  Basak Surajit (Bioinformatics Centre, Tripura University)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 1083  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 後天性免疫不全症候群(AIDS)は,ヒト免疫不全ウイルス(HIV)による感染に起因する状態のスペクトルである。HIV-1とHIV-2の2つの型を特性化した。本研究では,進化的選択圧がHIV-I感染者の急速進行因子(RP),緩徐進行因子(SP)および長期非進行因子(LTNP)の間で異なるかどうかを検討した。エンベロープ(env)遺伝子における置換の進化速度と疾患進行の間の予想外の関連が観察される。本研究は,LTNPのenv遺伝子がRPに関して異常に強い機能的制約を受けることを示唆する。また,env遺伝子の3つのカテゴリー,すなわち,RP,SP,およびLTNPは,それら自身のアミノ酸利用の特徴的パターンを持ち,SPおよびLTNP配列は,RP配列と異なるアミノ酸利用の類似パターンを共有し,進化速度は,3つの異なるタイプのenv遺伝子配列のアミノ酸利用パターンに有意に影響した。LTNPとSP配列のグリコシル化部位の進化率はRP配列よりも有意に低かった。env遺伝子の3つのカテゴリーに及ぼすヒト宿主の影響に関する比較分析は,病気の進行の速度と良く相関し,成功した居住と感染に対するウイルスの適応戦略を示唆する。宿主関連選択的制約はRP配列で最も緩和され,LTNP配列で最も強かった。本研究は,進化選択圧がenv遺伝子の3つのカテゴリー,すなわち,RP,SP,およびLTNPの間でどのように異なるかを明らかにする。env糖蛋白質をコードするenv遺伝子は,宿主免疫系へのそれらの一定の曝露により宿主からの厳しい選択制約を経験する。この観点において,env遺伝子進化はウイルス集団における固定に到達しない変異の発生による負の選択により主に起こることが示唆される可能性がある。本研究はまた,HIV感染の全体的進行を支配する宿主因子の重要な影響についてより深い洞察を与える。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： キャラクタリゼーション ,  *コドン ,  後天性免疫不全症候群 ,  グリコシル化 ,  遺伝子 ,  ヒト ,  糖タンパク質 ,  HIV1 ,  *HIV【ウイルス】 ,  感染 ,  *アミノ酸
準シソーラス用語： env遺伝子 ,  進化速度 ,  選択圧 ,  *エンベロープ蛋白質 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 急速な進歩 ,  遅い進行者 ,  長期非進行者 ,  進化速度 ,  病気の進行

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y)

タイトルに関連する用語 (7件)： HIV ,  エンベロープ蛋白質 ,  コドン ,  アミノ酸 ,  プロファイル ,  宿主 ,  遺伝的影響