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J-GLOBAL ID：201802225898261288   整理番号：18A1805196

シミュレーテッドアニーリングを用いた効率的生化学経路予測【JST・京大機械翻訳】

Efficient Biochemical Pathway Prediction Using Simulated Annealing

著者 (3件)： Xu Zhiqing (Department of Chemical Engineering and Applied Chemistry, University of Toronto, Toronto, ON M5S3E5, Canada) ,  Mahadevan Radhakrishnan (Department of Chemical Engineering and Applied Chemistry, University of Toronto, Toronto, ON M5S3E5, Canada) ,  Mahadevan Radhakrishnan (Institute of Biomaterials and Biomedical Engineering, University of Toronto, Toronto, ON M5S3G9, Canada)
資料名： IFAC PapersOnLine  (IFAC PapersOnLine)
巻： 51  号： 19  ページ： 56-57  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3101A  ISSN： 2405-8963  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 過去20年の間,多くの計算ツールが,新しい生化学的経路設計を助けるために開発された。しかし,より長い経路が予測されるとき,多数の化合物を有する推定反応ネットワークが,いくつかの反応段階後に生成される。化合物の数の組合せ成長は,経路探索木の拡大を非常に遅くし,その結果,すべての可能な経路の同定を計算的に困難にする。化学的類似性に基づく方法は,標的化合物への構造類似性に従って,反応ネットワークにおけるノードと分枝の数を減少させることを通して計算時間を節約するために開発されたが,この方法は目標化合物に比較的類似していない化合物を含む重要な経路を無視できる。ここでは,中間体が最終標的化合物と類似していない経路を予測する能力に関して経路予測の性能を改善する経路予測プログラムAnnealPathにおける新しいアルゴリズムを報告した。著者らは,より長い非線形経路を予測する効率を改善するために,グローバル最適化アルゴリズム,シミュレーテッドアニーリングを用いた。この新しいアルゴリズムはより計算効率が高く,より可能性のある経路を生成し,より短い経路のより高い数を同定できることを示すことができた。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アルゴリズム ,  *シミュレーテッドアニーリング ,  ネットワーク ,  *生化学 ,  類似性 ,  経路探索 ,  中間体 ,  *予測
準シソーラス用語： 計算効率 ,  最適アルゴリズム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (2件)： 生化学的経路設計 ,  シミュレーテッドアニーリング

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (4件)： シミュレーテッドアニーリング ,  生化学 ,  経路 ,  予測