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J-GLOBAL ID：201802225908833434   整理番号：18A1027634

多重質量スペクトルのためのグラフにおけるペプチド配列決定【JST・京大機械翻訳】

Peptide Sequencing in Graphs for Multiplex Mass Spectra

著者 (3件)： Garcia Damaso Jose Claudio ,  Guimaraes Solange ,  Souza Leite Pires de Lima Beatriz
資料名： IEEE Latin America Transactions  (IEEE Latin America Transactions)
巻： 16  号： 4  ページ： 1269-1275  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2450A  ISSN： 1548-0992  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究は多重質量スペクトルにおけるペプチド配列決定に対する発見を提示した。多重質量スペクトルをデコンボリューションする方法を開発し,各ペプチド標的質量に対する修飾特異スペクトルを生成した。各デコンボリューションスペクトルから指向スペクトルグラフを作成し,コスト関数を定義して,シーケンス経路を通して深さ第一探索アルゴリズムを導いた。この発見は,より高い強度を有するペプチドが無傷の多重スペクトルから正しく配列されることを考慮した。DNBuilderと呼ばれる計算システムを開発した。甲状腺試料からの質量スペクトルを用いて方法論を試験し,Peak,pNovoPlusおよびNovorとして文献からの3つのよく知られたプログラムと比較した。結果は,著者らの方法が,共フラグメント化ペプチドスペクトルにおける正しいアミノ酸配列決定量を強化することを示した。Copyright 2018 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： デコンボリューション ,  *ペプチド ,  計算機システム ,  *スペクトル ,  *アミノ酸配列 ,  *質量スペクトル ,  *多重化 ,  費用関数 ,  *グラフ ,  甲状腺
準シソーラス用語： 多重スペクトル ,  探索アルゴリズム , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 信号理論  (ND02020G)

タイトルに関連する用語 (4件)： 多重 ,  質量スペクトル ,  グラフ ,  ペプチド配列