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J-GLOBAL ID:201802225979102288   整理番号:18A0038232

東南アジアの潮汐と洪水が起こりやすい地域のイネ品種間におけるサブ1遺伝子座と対立遺伝子分布におけるハプロタイプ多様性【JST・京大機械翻訳】

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巻: 24  号:ページ: 198-206  発行年: 2017年 
JST資料番号: C2861A  ISSN: 1672-6308  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: 中国 (CHN)  言語: 英語 (EN)
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160の洪水傾向イネ品種の間の単一ヌクレオチド多型と制限消化ベースハプロタイプ変異を,酵素Alu IとCac8 Iを用いて分析し,それぞれSUB1Aとサブ1C遺伝子座(冠水耐性を付与する)における多形を発生させることができた。表現型と関連したハプロタイプを用いて,SUB1AおよびSub1C遺伝子座におけるハプロタイプ変異を研究し,冠水耐性および茎伸長に対するそれらの機能的影響を決定した。SUB1A遺伝子座における3つのパターン,サブ1A0(ヌル対立遺伝子),サブ1A1(切断しない)およびサブ1A2(1SNP),およびサブ1C遺伝子座における4つのパターン,Sub1C1,Sub1C2,Sub1C3およびSub1C4が生成された。耐性サブ1A1と不耐性Sub1A2の両方は同じ長さを有したが,サブ1A2の制限部位の存在があったが,サブ1A1では存在しなかった。8つのハプロタイプ(2つの遺伝子座の異なる組み合わせ),A1C1,A1c2,A1C4,A2C2,A2C4,A0C2,A0C3およびA0C4を160の品種の間で検出した。ハプロタイプA1C1は,同じSUB1A対立遺伝子を持つハプロタイプA1c2とA1C4に比較的関連しており,これらのハプロタイプはバングラデシュ,スリランカンおよびインドの品種においてのみ見出された。A1C1ハプロタイプにおけるほとんどの耐性品種は,耐性特異的サブ1A1およびサブ1C1対立遺伝子を有する遅い伸長を示した。さらに,品種Madabaru及びKottamali(A2C2)もSub1A1対立遺伝子を含まない中程度の耐性レベルを示した。これらの品種は,FR13Aと異なり,他の遺伝子座で異なる新規耐性遺伝子を運ぶことも疑われた。これらの材料は,イネにおける冠水耐性を改善するための単一遺伝子型への付加的耐性特異的対立遺伝子のピラミッド化のためのSub1品種との交雑に使用できる。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】
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分類 (3件):
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遺伝子の構造と化学  ,  稲作  ,  植物生理学一般 
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