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J-GLOBAL ID：201802226350780654   整理番号：18A1296916

中国,ビルマ及びラオスの国境都市,Xishuangbannaにおける2017デング熱発生の完全ゲノム特性化【JST・京大機械翻訳】

Complete Genome Characterization of the 2017 Dengue Outbreak in Xishuangbanna, a Border City of China, Burma and Laos

著者 (29件)： Wen Songjiao (Institute of Medical Biology, Peking Union Medical College, Chinese Academy of Medical Sciences) ,  Wen Songjiao (Yunnan Key Laboratory of Vaccine Research and Development on Severe Infectious Diseases) ,  Wen Songjiao (Yunnan Key Laboratory of Vector-borne Infectious Disease) ,  Ma Dehong (Xishuangbanna Dai Autonomous Prefecture People’s Hospital) ,  Lin Yao (Institute of Medical Biology, Peking Union Medical College, Chinese Academy of Medical Sciences) ,  Lin Yao (Yunnan Key Laboratory of Vaccine Research and Development on Severe Infectious Diseases) ,  Lin Yao (Yunnan Key Laboratory of Vector-borne Infectious Disease) ,  Li Lihua (Xishuangbanna Dai Autonomous Prefecture People’s Hospital) ,  Hong Shan (Institute of Medical Biology, Peking Union Medical College, Chinese Academy of Medical Sciences) ,  Hong Shan (Yunnan Key Laboratory of Vaccine Research and Development on Severe Infectious Diseases) ,  Hong Shan (School of Basic Medicine, Kunming Medical University) ,  Li Xiaoman (Institute of Pediatric Disease Research, The Affiliated Children’s Hospital of Kunming Medical University) ,  Wang Xiaodan (Institute of Medical Biology, Peking Union Medical College, Chinese Academy of Medical Sciences) ,  Wang Xiaodan (Yunnan Key Laboratory of Vaccine Research and Development on Severe Infectious Diseases) ,  Wang Xiaodan (Yunnan Key Laboratory of Vector-borne Infectious Disease) ,  Xi Juemin (Institute of Medical Biology, Peking Union Medical College, Chinese Academy of Medical Sciences) ,  Xi Juemin (Yunnan Key Laboratory of Vaccine Research and Development on Severe Infectious Diseases) ,  Xi Juemin (Yunnan Key Laboratory of Vector-borne Infectious Disease) ,  Qiu Lijuan (Institute of Pediatric Disease Research, The Affiliated Children’s Hospital of Kunming Medical University) ,  Pan Yue (Institute of Medical Biology, Peking Union Medical College, Chinese Academy of Medical Sciences) ,  Pan Yue (Yunnan Key Laboratory of Vaccine Research and Development on Severe Infectious Diseases) ,  Pan Yue (Yunnan Key Laboratory of Vector-borne Infectious Disease) ,  Chen Junying (Institute of Medical Biology, Peking Union Medical College, Chinese Academy of Medical Sciences) ,  Chen Junying (Yunnan Key Laboratory of Vaccine Research and Development on Severe Infectious Diseases) ,  Chen Junying (Yunnan Key Laboratory of Vector-borne Infectious Disease) ,  Shan Xiyun (Xishuangbanna Dai Autonomous Prefecture People’s Hospital) ,  Sun Qiangming (Institute of Medical Biology, Peking Union Medical College, Chinese Academy of Medical Sciences) ,  Sun Qiangming (Yunnan Key Laboratory of Vaccine Research and Development on Severe Infectious Diseases) ,  Sun Qiangming (Yunnan Key Laboratory of Vector-borne Infectious Disease)
資料名： Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (Web)  (Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 148  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7063A  ISSN： 2235-2988  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： デング熱発生は,中国,ミャンマー,およびラオスの境界において,2017年6月に突然発生した。2017年11月3日までに,1184人の感染した個人を,境界に位置する都市,NS1-陽性静脈Xisuangbannaとして確認した。原因物質を検証するために,完全なゲノム情報を,患者サンプルから抽出されたウイルスRNAに基づくPCRと塩基配列決定を通して得た。系統樹を最大尤度法(MEGA6.0)により構築した。ヌクレオチドおよびアミノ酸置換をBioEditにより分析し,続いて非翻訳領域(UTR)のRNA二次構造予測およびコード配列(CDSs)における蛋白質二次構造予測を行った。菌株YN2,YN17741,およびYN176272を,地方住民から分離した。染色MY21とMY22をバーメース旅行者から分離した。5分離株の完全ゲノム配列は長さ10735ヌクレオチドであった。系統発生分析は,DENV-1の遺伝子型Iとして5つの分離株すべてを分類し,一方,地方の住民とバーメース旅行者の分離株は異なる枝に属した。3つの局所的分離株は2011年にDongguan株に最も類似しており,Burmese旅行者からの他の2つの分離株は2008年にLaos株に最も類似していた。24アミノ酸置換は8進化樹枝において重要であった。DENV-1SSとの比較は,YN17741に排他的な2つの突然変異を除いて,局所分離株における658塩基置換を明らかにし,87の同義突然変異をもたらした。局所分離株と比較して,52のアミノ酸突然変異は,バーメース旅行者からの2つの分離株のCDSにおいて発生した。MY21をMY22と比較すると,17のアミノ酸突然変異が観察され,これら全ての変異は非構造化蛋白質(NS1で2,NS2で10,NS3で2,NS5で3)のCDSで起こった。二次構造予測は,局所分離株におけるCDSsの潜在的ヌクレオチドおよび蛋白質結合部位における46の変化を明らかにした。RNA二次構造予測はまた,局所分離株の3′UTRにおける塩基変化を示し,RNA二次構造における2つの有意な変化をもたらした。著者らの知る限り,本研究は,中国,Burma,およびLaosの境界地域で発生した2017のデング熱発生からの分離株の最初の完全なゲノム分析である。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *ゲノム ,  塩基対置換 ,  *デング熱 ,  遺伝子型 ,  タンパク質 ,  *ラオス人民民主共和国 ,  *キャラクタリゼーション ,  ヌクレオチド ,  アミノ酸 ,  系統樹 ,  患者 ,  ヌクレオチド配列 ,  予測 ,  分離株 ,  旅行者

著者キーワード (5件)： デング熱発生 ,  完全ゲノム ,  系統樹 ,  RNA二次構造 ,  蛋白質二次構造

分類 (2件)： ウイルスの生化学  (EG04030F) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

タイトルに関連する用語 (8件)： 中国 ,  ビルマ ,  ラオス ,  国境 ,  都市 ,  デング熱 ,  ゲノム ,  特性化