ゲノムワイド関連マッピングはインディカ米における実生段階の低温ストレスに対する複数の調節耐性応答を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Pandit Elssa; Tasleem Swaleha; Barik Saumya R.; Mohanty Durga P.; Nayak Deepak K.; Mohanty Shakti P.; Das Sujata; Pradhan Sharat K.

文献

J-GLOBAL ID：201802226493689476 整理番号：18A0805648

ゲノムワイド関連マッピングはインディカ米における実生段階の低温ストレスに対する複数の調節耐性応答を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Association Mapping Reveals Multiple QTLs Governing Tolerance Response for Seedling Stage Chilling Stress in Indica Rice

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資料名：
巻： 8 ページ： 552 発行年： 2017年
JST資料番号： U7094A ISSN： 1664-462X 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：スイス (CHE) 言語：英語 (EN)

イネ作物は苗期の寒冷ストレスに敏感である。インディカ米における実生期の低温耐性について,304のショートリスト生殖質系統を代表する集団のパネルを研究した。6つの表現型クラスを,応答パターンを調査するために,制御表現型分類施設の下で6つの低温ストレス領域に曝露した。すべての表現型クラスを表す66の遺伝子型のパネルを用いて,58の単純配列反復(SSR)と2つの直接形質連鎖マーカーを用いて形質の遺伝的多様性,個体群構造および関連マッピングを確実にした。遺伝的多様性の中程度のレベルが,形質のためのパネル集団において検出された。Hardy-Weinbergの期待値の偏差を,WrightのF統計を用いて研究した母集団において検出した。パネルは個体群間で30%の変異を示し,個体間で70%を示した。全集団をSTRUCTURE分析を通して3つのサブ集団に分類した。これは,形質に対する耐性が,いくつかの混合個体を持つ各サブ集団に対して共通の一次祖先を持つことを明らかにした。パネル集団は,形質の全ゲノム発現を代表する個体における寒冷ストレス耐性に対する多くのQTLの存在を示した。19のSSRマーカーは,7~21日間,8°C~4°Cの低温ストレスで有意に関連した。このように,実生期耐寒性QTL,qCTS9,qCTS-2,qCTS6.1,qSCT2,qCTS11,qSCT1a,qCTS11,qCTS1a,qCTS12.1,qCTS-1bおよびCtb2にリンクしたプライマーは,強い低温耐性品種の開発のためにピラミッド化する必要があった。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

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遺伝的変異 , 遺伝子の構造と化学

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