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J-GLOBAL ID：201802226587025380   整理番号：18A0573483

ブタを侵す7種のウイルスの検出と鑑別のための多重逆転写PCRと自動化電子マイクロアレイ分析【Powered by NICT】

A multiplex reverse transcription PCR and automated electronic microarray assay for detection and differentiation of seven viruses affecting swine

著者 (10件)： Erickson A. (Lethbridge Laboratory, National Centres for Animal Disease, Canadian Food Inspection Agency, Lethbridge, AB, Canada) ,  Fisher M. (Lethbridge Laboratory, National Centres for Animal Disease, Canadian Food Inspection Agency, Lethbridge, AB, Canada) ,  Furukawa-Stoffer T. (Lethbridge Laboratory, National Centres for Animal Disease, Canadian Food Inspection Agency, Lethbridge, AB, Canada) ,  Ambagala A. (Lethbridge Laboratory, National Centres for Animal Disease, Canadian Food Inspection Agency, Lethbridge, AB, Canada) ,  Hodko D. (Nexogen, Inc., San Diego, CA, USA) ,  Pasick J. (National Centres for Foreign Animal Disease, Canadian Food Inspection Agency, Winnipeg, MB, Canada) ,  King D. P. (The Pirbright Institute, Pirbright, UK) ,  Nfon C. (National Centres for Foreign Animal Disease, Canadian Food Inspection Agency, Winnipeg, MB, Canada) ,  Ortega Polo R. (Lethbridge Laboratory, National Centres for Animal Disease, Canadian Food Inspection Agency, Lethbridge, AB, Canada) ,  Lung O. (Lethbridge Laboratory, National Centres for Animal Disease, Canadian Food Inspection Agency, Lethbridge, AB, Canada)
資料名： Transboundary and Emerging Diseases  (Transboundary and Emerging Diseases)
巻： 65  号： 2  ページ： e272-e283  発行年： 2018年 
JST資料番号： A1558A  ISSN： 1865-1674  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： は多数の遺伝的特徴の存在下または非存在下の同時測定を可能にするマイクロアレイ技術は病原体検出に有用である。しかし,ほとんどのマイクロアレイ分析は労働集約的で時間がかかる。本研究では,ブタに影響する(口蹄疫ウイルス[FMDV],ブタ水ほう病ウイルス(SVDV],ブタウイルスの小水疱性発疹[VESV],アフリカブタ熱ウイルス(ASFV],古典的ブタ熱ウイルス(CSFV),ブタ繁殖呼吸障害症候群ウイルス(PRRSV]およびブタサーコウイルス2型(PCV2)七重要なウイルスの同時検出と鑑別のための多重逆転写(RT)-PCRと新規付随する自動化電子マイクロアレイ試験の開発と初期評価について述べた。新しい電子マイクロアレイ分析は四百の特徴を用いた使い捨て電子マイクロアレイカートリッジに捕捉プローブ印刷,ハイブリダイゼーション,洗浄と報告を統合し自動化する単一,ユーザフレンドリーな機器を利用した。このアッセイは,正確にFMDVの23試料,七種全ての血清型を表すと10CSFV株を含む七標的ウイルス種の68株を検出し,同定された全ての三遺伝子型を示した。アッセイは,実験的に感染した動物(という早い時期にFMDVとSVDVに対する1日感染後(dpi),ASFV4dpi,CSFV5dpi)からだけでなく,標的ウイルスを添加した生体試料中の臨床試料中のウイルスの検出に成功した。検出限界はFMDVのASFV,PCV2とPRRSV,SVDVの100コピー/μl,CSFV,VESVおよび1,000コピー/μlの10コピー/μlであった。マルチプレックスRT-PCRと比較して電子マイクロアレイ成分は,いくつかの標的ウイルスの分析感度を減少させた。必要とされる捕捉プローブ印刷の統合は,カスタムオンサイトアレイ印刷を可能にし,一方,電気泳動的に駆動されたハイブリダイゼーション結果は,受動ハイブリダイゼーションに依存する従来のマイクロアレイよりも速く結果を生成する。更なる微細化に伴い,この新規,迅速,高度に自動化されたマイクロアレイ技術は,家畜疾患の多病原菌監視への応用の可能性を持っている。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *自動化 ,  分子ハイブリダイゼーション ,  感染 ,  *多重化 ,  遺伝子型 ,  *DNAマイクロアレイ ,  捕獲 ,  生体試料 ,  プローブ ,  *ウイルス ,  血清型 ,  動物 ,  検出限界 ,  *鑑別
準シソーラス用語： *マイクロアレイ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： アフリカ豚コレラ ,  ブタコレラ ,  口蹄疫 ,  マイクロアレイ ,  マルチプレックスPCR ,  ブタ水ほう病

分類 (2件)： ウイルスの生化学  (EG04030F) ,  ウイルスによる動物の伝染病  (FE02024R)

タイトルに関連する用語 (8件)： ブタ ,  ウイルス ,  鑑別 ,  多重 ,  逆転写PCR ,  自動化 ,  電子 ,  マイクロアレイ分析