文献

J-GLOBAL ID：201802226593428826   整理番号：18A1381841

遺伝子発現情報を用いたPPIネットワークにおける複雑な検出【JST・京大機械翻訳】

Complex Detection in PPI Network Using Genes Expression Information

著者 (3件)： Zhang Zehua (School of Computer Science and Technology, Tianjin University, Tianjin, China) ,  Tang Jijun (School of Computer Science and Technology, Tianjin University, Tianjin, China) ,  Guo Fei (School of Computer Science and Technology, Tianjin University, Tianjin, China)
資料名： Current Proteomics  (Current Proteomics)
巻： 15  号： 2  ページ： 119-127  発行年： 2018年 
JST資料番号： W3616A  ISSN： 1570-1646  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 不明 (ARE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:PPIネットワークからの蛋白質複合体の同定は,蛋白質機能を解明し,細胞におけるシグナル伝達と生物学的過程を同定するための重要な問題になっている。【目的】PPIネットワークにおける複合体の正確な測定は,細胞組織の原理を理解するために重要である。方法:PPIネットワーク上の蛋白質複合体を同定する新しい方法を提案した。最初に,著者らは,PPIネットワークに関する複合体を計算するために,エッジ重みづけ方式によってMarkovクラスタアルゴリズムを使用した。第二に,著者らは,示差共発現情報に基づいて,各蛋白質複合体を測定するための新しい共発現分析法を設計した。結果:著者らの方法を評価するために,2つの酵母PPIネットワーク上で実験を行った。DIPネットワークにおいて,本方法は,0.5014と0.5219の精度とF測定値を有し,それは,COACHに対して0.2896と0.3211,ClusterONEに対して0.4252と0.3675の精度とF測定値を改善した。MIPSネットワークにおいて,この方法はF測定値が0.3597であり,COACHに対して0.2497,ClusterONEに対して0.3326のF測定値を改善した。【結論】著者らの方法は,動的PPIネットワーク上の蛋白質複合体を同定するためのいくつかの最先端の方法より良い結果を達成し,予測は改善された。Copyright 2018 Bentham Science Publishers All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  *遺伝子発現 ,  複合体 ,  タンパク質複合体 ,  重みづけ ,  クラスタ ,  細胞構成体 ,  *ネットワーク ,  アルゴリズム ,  エッジ検出 ,  酵母
準シソーラス用語： 最先端 ,  共発現 ,  生物学的過程 ,  蛋白質機能 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 共発現情報 ,  複雑な検出 ,  遺伝子発現 ,  遺伝子 ,  Markovクラスタアルゴリズム ,  PPIネットワーク

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (2件)： 遺伝子発現 ,  PPI