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J-GLOBAL ID：201802226605221533   整理番号：18A0787901

酸性鉱山排水によって影響された堆積物における硝化菌の遺伝子量と多様性【JST・京大機械翻訳】

Nitrifier Gene Abundance and Diversity in Sediments Impacted by Acid Mine Drainage

著者 (4件)： Ramanathan Bhargavi (Department of Integrative Biology, University of Colorado Denver) ,  Boddicker Andrew M. (Department of Integrative Biology, University of Colorado Denver) ,  Roane Timberley M. (Department of Integrative Biology, University of Colorado Denver) ,  Mosier Annika C. (Department of Integrative Biology, University of Colorado Denver)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 8  ページ： 2136  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 極度に酸性で金属に富む酸性鉱山排水(AMD)水は,水生生態系に対して厳しい毒性学的影響を持つことができる。AMDは硝化を完全に停止させることが示されており,それは窒素をより高い生物に移動させ,窒素汚染を軽減するのに重要な役割を果たしている。AMD影響堆積物における硝化微生物の遺伝子豊度と多様性を評価した:アンモニア酸化古細菌(AOA),アンモニア酸化細菌(AOB),亜硝酸酸化細菌(NOB)。2013年と2014年の初夏と晩夏の間に,試料をアイロン春鉱山地区(Ophir,CO,合衆国)から収集した。多くのサイトは低pH(<5)と高金属濃度によって特徴付けられた。配列分析により,Nitrososphaera,Nitrosotalea,Nitrosoarchumに関連するAOA遺伝子を明らかにした。NitrosomonasとNitrosospiraに関連するAOB遺伝子;そして,NOB遺伝子はNitrospiraに関連した。AOA,AOBおよびNOBの全体的存在量を,amoAおよびnxrB機能遺伝子および16S rRNA遺伝子の定量的PCR(qPCR)増幅を用いて調べた。遺伝子コピー数は,3.2×10~4~4.9×10~7古細菌amoAコピー*μg DNA~-1,1.5×10~3~5.3×10~5AOB 16S rRNAコピー*μg DNA~-1,1.3×10~6~7.7×10~7Nitrospira nxrBコピー*μg DNA~-1の範囲であった。全体として,Nitrospira nxrB遺伝子は,2013年と2014年にわたるほとんどのサンプルサイトにおいて,AOB 16S rRNAと古細菌amoA遺伝子より豊富であることが分かった。AOB 16S rRNAとNitrospira nxrB遺伝子を3.2と低いpHの堆積物で定量し,AOA amoA遺伝子を3.5の低い堆積物で定量した。pHは全サイト(pH3.2~8.3)を通して変化したが,pHは全ての遺伝子(CCA及びスピアマン相関に基づく)に対する個々のOTUsの全体的群集構造又は相対存在量と強く相関しなかった。pHはAOB 16S rRNA遺伝子の総存在量(qPCR)と正の相関を示したが,他の遺伝子では相関しなかった。金属は全体的な硝化細菌群集組成あるいは豊度と相関しなかったが,いくつかの個々のOTUsの相対的存在量と相関した。これらの知見は,AMD影響システムにおける硝化微生物の分布の理解を拡張し,さらなる研究のためのプラットフォームを提供する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 窒素 ,  *硝酸化成菌 ,  古細菌 ,  Nitrosomonas ,  *硝化 ,  定量的PCR法 ,  *遺伝子 ,  *堆積物
準シソーラス用語： 細菌群集構造 ,  amoA遺伝子 ,  16S rRNA ,  16S rRNA遺伝子 ,  Nitrospira ,  アンモニア酸化細菌 ,  アンモニア酸化古細菌 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 酸性鉱山排水 ,  硝化 ,  アンモニア酸化古細菌 ,  アンモニア酸化細菌 ,  亜硝酸酸化細菌

分類 (1件)： 微生物の生態  (EG03040J)

タイトルに関連する用語 (5件)： 酸性鉱山排水 ,  堆積物 ,  硝化菌 ,  遺伝子量 ,  多様性