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J-GLOBAL ID：201802226718462462   整理番号：18A0471065

2五大湖支流における稀なと侵入魚種の環境DNA検出【Powered by NICT】

Environmental DNA detection of rare and invasive fish species in two Great Lakes tributaries

著者 (6件)： Balasingham Katherine D. (Department of Biology, Great Lakes Institute for Environmental Research, University of Windsor, Windsor, ON, Canada) ,  Walter Ryan P. (Department of Biology, Great Lakes Institute for Environmental Research, University of Windsor, Windsor, ON, Canada) ,  Walter Ryan P. (Great Lakes Laboratory for Fisheries and Aquatic Sciences, Fisheries and Oceans Canada, Burlington, ON, Canada) ,  Mandrak Nicholas E. (Great Lakes Laboratory for Fisheries and Aquatic Sciences, Fisheries and Oceans Canada, Burlington, ON, Canada) ,  Mandrak Nicholas E. (Department of Biological Sciences, University of Toronto Scarborough, Toronto, ON, Canada) ,  Heath Daniel D. (Department of Biology, Great Lakes Institute for Environmental Research, University of Windsor, Windsor, ON, Canada)
資料名： Molecular Ecology  (Molecular Ecology)
巻： 27  号： 1  ページ： 112-127  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2684A  ISSN： 0962-1083  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 水生環境試料からのDNAの抽出と特性化は,希少種の検出のための代替,非侵襲的方法を提供する。PCRおよび次世代シークエンシング(「metabarcoding」)と結合した,環境DNAは希少水生種の検出のための非常に高感度であることが分かった。著者らの研究は,リスク(東部砂ヘビウ,Ammocrypta pellucida;北部madtom,Noturus stigmosus,銀Shiner,Notropis photogenis),1つの侵入種(ラウンドゴビー,Neogobius melanostomus)とカナダ,オンタリオ州南部の二大五大湖支流河川からの付加的な78在来種で三種の検出のためのカスタム設計グループ特異的プライマーセットおよび次世代シークエンシングを用いた:Grand川とSydenham川。捕獲とeDNA法を用いて両河川で検出された82魚種のうち,eDNA法はGrand川とSydenham川における魚種の86.2%と72.0%をそれぞれ検出され,四標的種を含んでいた。著者らの分析はまた,標的種と他の同定された種の間に有意な正と負の種共起パターンを同定した。著者らの結果は,関心のある個々の種と同様に魚類群集を標的とするeDNA metabarcodingは標的種データのみで可能であったよりも生態系における標的種の空間分布に影響する因子のより良好な理解を提供することを示した。さらに,eDNAは初期調査ツールとして,あるいは捕獲法に沿って実装し,種の分布パターンのマッピングを改善するための容易にした。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： *DNA【核酸】 ,  生態系 ,  在来種 ,  空間分布 ,  魚群 ,  捕獲 ,  オンタリオ州 ,  河川
準シソーラス用語： *侵入 ,  *魚種 ,  侵入種 ,  次世代シークエンシング ,  *環境DNA ,  *外来魚 ,  *五大湖 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 絶滅危惧種 ,  環境DNA ,  魚類群集 ,  侵入 ,  次世代配列決定

分類 (4件)： 動物に対する影響  (EE05040R) ,  その他の汚染原因物質  (SB05040W) ,  河川汚濁  (SB02020F) ,  バイオアッセイ  (EA03060N)

タイトルに関連する用語 (5件)： 五大湖 ,  支流 ,  侵入 ,  魚種 ,  環境DNA