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J-GLOBAL ID:201802227080311162   整理番号:18A0975431

複数のゲノムアプローチによる乳癌細胞株の分子特性化【JST・京大機械翻訳】

Molecular characterization of breast cancer cell lines through multiple omic approaches
著者 (11件):
資料名:
巻: 19  号:ページ: 65  発行年: 2017年 
JST資料番号: U7313A  ISSN: 1465-542X  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: イギリス (GBR)  言語: 英語 (EN)
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【背景】乳癌細胞株は,乳癌の細胞特性と生物学を研究するためのモデルシステムとして頻繁に使用される。著者らの目的は,特定の研究のための細胞系の選択におけるより情報のある決定を行うことを可能にするために,アメリカ型文化収集(ATCC 30~4500K)から得られた乳癌細胞株の大規模で一般的に使用されるパネルを特性化することであった。これらの細胞株についての情報は広範囲のソースから得られた。加えて,各細胞系内で活性化される細胞経路に関する新しい情報が生成された。【方法】免疫ブロット分析を用いて重要な蛋白質発現データを測定した。さらに,これらの細胞で活性化される細胞蛋白質と経路を同定するために,血清飢餓細胞に関する2つの分析を行った。これらの分析は,市販のPathScanアレイと,主要なシグナル伝達経路における1290のリン酸化イベントを質問する新規でより広範なホスホペプチドに基づくキノーム分析を用いて行った。乳癌細胞株のこのパネルについてのデータを,いくつかのオンラインソースからアクセスし,次の領域についてまとめた。すなわち,分子分類,mRNA発現,主要蛋白質の変異状態および他の可能な癌関連突然変異,および乳癌のマウス異種移植モデルにおける腫瘍形成および転移能である。【結果】特性化された細胞株は,4つの非腫瘍形成性乳房細胞株に加えて,10のエストロゲン受容体(ER)陽性,12のヒト上皮成長因子受容体2(HER2)増幅および18の三重陰性乳癌細胞株を含んだ。各サブタイプ内で,モデル細胞株の選択と得られた結果の解釈の両方に影響を与える有意な遺伝的不均一性があった。これらの変異組合せの結果として重要なシグナル伝達経路の正味活性化を捉えるために,プロファイリング経路活性化状態を調べた。これにより,細胞株が特に一般的あるいは独特の方法で脱調節されることが明らかになった。【結論】これらの2つの新しいキナーゼまたは「Kin-OMIC」分析は,これらの頻繁に使用される乳癌細胞株についての重要なデータのもう一つの次元を追加する。これは,乳癌研究に使用するために最も適切な細胞系を選択する研究者を支援し,出現する結果の解釈のための文脈を提供する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (3件):
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抗腫よう薬の基礎研究  ,  細胞生理一般  ,  腫ようの化学・生化学・病理学 
引用文献 (68件):
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タイトルに関連する用語 (4件):
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