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J-GLOBAL ID：201802227186195044   整理番号：18A2069114

リガンドはリボスイッチ折畳みと転写休止の間の交差カップリングを調節する【JST・京大機械翻訳】

Ligand Modulates Cross-Coupling between Riboswitch Folding and Transcriptional Pausing

著者 (13件)： Widom Julia R. (Single Molecule Analysis Group, Department of Chemistry, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109, USA) ,  Widom Julia R. (Center for RNA Biomedicine, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109, USA) ,  Nedialkov Yuri A. (Department of Microbiology, The Ohio State University, Columbus, OH 43210, USA) ,  Nedialkov Yuri A. (Center for RNA Biology, The Ohio State University, Columbus, OH 43210, USA) ,  Rai Victoria (Single Molecule Analysis Group, Department of Chemistry, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109, USA) ,  Rai Victoria (Center for RNA Biomedicine, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109, USA) ,  Rai Victoria (Biophysics Program and Department of Chemistry, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109, USA) ,  Hayes Ryan L. (Biophysics Program and Department of Chemistry, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109, USA) ,  Brooks Charles L. (Biophysics Program and Department of Chemistry, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109, USA) ,  Artsimovitch Irina (Department of Microbiology, The Ohio State University, Columbus, OH 43210, USA) ,  Artsimovitch Irina (Center for RNA Biology, The Ohio State University, Columbus, OH 43210, USA) ,  Walter Nils G. (Single Molecule Analysis Group, Department of Chemistry, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109, USA) ,  Walter Nils G. (Center for RNA Biomedicine, University of Michigan, Ann Arbor, MI 48109, USA)
資料名： Molecular Cell  (Molecular Cell)
巻： 72  号： 3  ページ： 541-552.e6  発行年： 2018年 
JST資料番号： W1167A  ISSN： 1097-2765  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多くのクラスのリボスイッチは,生理的合図に応答して細菌遺伝子発現を調節することが見出され,抗菌薬に対する新しい経路を提供する。分離リボスイッチの一般的な研究は,転写機構の機能的文脈を欠いているので,ここでは,単一分子,生化学的およびシミュレーションアプローチを組み合わせて,シュードノット構造化preQ_1リボスイッチおよびRNAポリメラーゼ(RNAP)の共転写折畳み間の結合を調べた。リボスイッチのすぐ下流の部位における休止は,新生RNAにおけるリガンドのないシュードノット,休止コンセンサスに似た正確な間隔配列,及びRNAP出口チャンネルとの静電及び立体相互作用を必要とすることを示した。RNAPとの相互作用はリボスイッチの天然折畳みを安定化するが,リガンドシグナルの結合は休止から放出される。著者らの結果は,新生リボスイッチとそのリガンドがRNAPの機能を活発に調節し,その逆に,他の細胞RNA転写物に適用する可能性のあるパラダイムであることを示す。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子発現 ,  構造形成 ,  RNA【核酸】 ,  相互作用 ,  *交差カップリング反応 ,  シミュレーション ,  チャネル ,  RNAポリメラーゼ ,  細菌 ,  抗細菌薬 ,  *折畳み
準シソーラス用語： 共転写 ,  シュードノット ,  単一分子 ,  *リボスイッチ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： リボスイッチ ,  単一分子FRET ,  RNAポリメラーゼ ,  休止 ,  共転写折畳み

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  核酸一般  (EB04010U)

タイトルに関連する用語 (7件)： リガンド ,  リボスイッチ ,  折畳み ,  転写 ,  休止 ,  交差カップリング ,  調節