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J-GLOBAL ID：201802227539082596   整理番号：18A0161469

ALL CQS:品質スコアの適応局所性基盤損失性圧縮【Powered by NICT】

ALL-CQS: Adaptive locality-based lossy compression of quality scores

著者 (2件)： Fu Jiabing (Communication & Computer Network Lab of Guangdong, School of Computer Science & Engineering, South China University of Technology, Wushan Road 381, Guangzhou, China) ,  Dong Shoubin (Communication & Computer Network Lab of Guangdong, School of Computer Science & Engineering, South China University of Technology, Wushan Road 381, Guangzhou, China)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2017  号： BIBM  ページ： 353-359  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ランダム性とやかましさに起因して,配列データで提示された品質スコアは既に圧縮貯蔵の約70%を構成し,それらの無損失圧縮限界に達した。品質スコアの非可逆圧縮,その後の変異体コーリング手順の性能を保証する,理想的な候補と大きなゲノムデータ解析における大きな課題である。現在,すべての品質スコア系は,単一の局所性を示すはずであるという仮定に基づいて,最新の局所性損失のある圧縮機PBlockは全ての異なる品質スコア線を平滑化するために手動で同一であり,静的局所基準を適用した。しかし,この仮定は実際の事例を通常ではなく,いくつかの品質スコア系における準最適局所性基準,最終的に損失性圧縮と変異体呼び出し法の性能劣化につながるをもたらすであろう。,様々な品質スコア系統は異なる局所性を示すはずであるより合理的な仮定に基づいて,ALL CQSと呼ばれる損失性圧縮機PBlockの拡張版を提案した。本論文では,ALL CQSはPBlockの損失機構に基づいて自動的に平滑異なる品質alityスコア線に適応局所基準を適用した。実験を行いその結果,提案損失圧縮機ALL CQSである無損失1に非常に近い最良の変異体コーリング性能を達成するだけでなく,すべての他の最新の損失のある圧縮機に勝っていると圧縮比の意味で元の無損失圧縮機に比べて最大145%の改善を達成することを明らかにした。Copyright 2018 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 平滑化 ,  *局所性 ,  データ解析 ,  ゲノム ,  圧縮比 ,  *品質 ,  圧縮機
準シソーラス用語： 性能劣化 ,  ランダム性 ,  *スコア , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： その他の情報処理  (JE15050M) ,  計算理論  (JB02000A)

タイトルに関連する用語 (6件)： ALL ,  スコア ,  適応 ,  局所性 ,  基盤 ,  損失