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J-GLOBAL ID：201802227568098480   整理番号：18A0331864

RNA-Seqによる3Siniperca種における種特異的なマイクロサテライトマーカーの同定【Powered by NICT】

Identification of species-specific microsatellite markers in three Siniperca species by RNA-Seq

著者 (16件)： Tian Changxu (College of Fisheries, Chinese Perch Research Center, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China) ,  Tian Changxu (Freshwater Aquaculture Collaborative Innovation Center of Hubei Province, Key Lab of Freshwater Animal Breeding, Ministry of Agriculture, Wuhan 430070, China) ,  Guo Wenjie (College of Fisheries, Chinese Perch Research Center, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China) ,  Guo Wenjie (Freshwater Aquaculture Collaborative Innovation Center of Hubei Province, Key Lab of Freshwater Animal Breeding, Ministry of Agriculture, Wuhan 430070, China) ,  Liang Xu-Fang (College of Fisheries, Chinese Perch Research Center, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China) ,  Liang Xu-Fang (Freshwater Aquaculture Collaborative Innovation Center of Hubei Province, Key Lab of Freshwater Animal Breeding, Ministry of Agriculture, Wuhan 430070, China) ,  Sun Longfang (College of Fisheries, Chinese Perch Research Center, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China) ,  Sun Longfang (Freshwater Aquaculture Collaborative Innovation Center of Hubei Province, Key Lab of Freshwater Animal Breeding, Ministry of Agriculture, Wuhan 430070, China) ,  Lv Liyuan (College of Fisheries, Chinese Perch Research Center, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China) ,  Lv Liyuan (Freshwater Aquaculture Collaborative Innovation Center of Hubei Province, Key Lab of Freshwater Animal Breeding, Ministry of Agriculture, Wuhan 430070, China) ,  Zhao Cheng (College of Fisheries, Chinese Perch Research Center, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China) ,  Zhao Cheng (Freshwater Aquaculture Collaborative Innovation Center of Hubei Province, Key Lab of Freshwater Animal Breeding, Ministry of Agriculture, Wuhan 430070, China) ,  Song Yi (College of Fisheries, Chinese Perch Research Center, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China) ,  Song Yi (Freshwater Aquaculture Collaborative Innovation Center of Hubei Province, Key Lab of Freshwater Animal Breeding, Ministry of Agriculture, Wuhan 430070, China) ,  He Shan (College of Fisheries, Chinese Perch Research Center, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China) ,  He Shan (Freshwater Aquaculture Collaborative Innovation Center of Hubei Province, Key Lab of Freshwater Animal Breeding, Ministry of Agriculture, Wuhan 430070, China)
資料名： Biochemical Systematics and Ecology  (Biochemical Systematics and Ecology)
巻： 70  ページ： 126-131  発行年： 2017年 
JST資料番号： E0821A  ISSN： 0305-1978  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Siniperca chuatsi Siniperca kneri,Siniperca scherzeriは中国における最も重要な三つのスズキ養殖魚種である。形態学的類似性のために,それらを区別,特に幼若期では困難である。さらに,それらの間の種間交雑は,経済的利益のために行われてきたが,種の同定をより困難。種特異的遺伝子マーカーは,それらの間の種同定に必要である。本研究では,全991個のSSRプライマー対のRNA-Seqによる8923個のSSRを含む配列(転写物>1kb)で同定した。566遺伝子座はプライマー合成とそのうちの394はS.chuatsiにおいて成功裏に増幅されたのためにランダムに選択した。全ての非多様体遺伝子座(308)は三Siniperca種間評価し,18種特異的マイクロサテライトマーカーが最終的に三Siniperca種間で検証した。これらの種特異的マイクロサテライトマーカーは若年期でのこれら三Siniperca種を識別容易にでなく,遺伝資源保護のためのハイブリダイゼーションと遺伝子移入の状態のモニタリングに有効であろう。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 遺伝子導入 ,  多様体 ,  類似性 ,  中華人民共和国 ,  *マイクロサテライト ,  モルフォロジー ,  RNA【核酸】
準シソーラス用語： 遺伝資源保全 ,  種判別 ,  遺伝子マーカ ,  経済的利益 ,  種間交雑 ,  若年 ,  養殖魚 ,  *マイクロサテライトマーカー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： RNA-Seq ,  種特異的なマイクロサテライト ,  Siniperca chuatsi ,  Siniperca kneri ,  Siniperca scherzeri

分類 (2件)： 植物分類学  (EH01030N) ,  集団遺伝学  (EC01040J)

タイトルに関連する用語 (3件)： RNA-seq ,  マイクロサテライトマーカー ,  同定