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J-GLOBAL ID：201802227824787562   整理番号：18A0196027

部分DNA配列決定データを用いた予測ゲノム解析【Powered by NICT】

Predictive Genome Analysis Using Partial DNA Sequencing Data

著者 (3件)： Ahmed Nauman ,  Bertels Koen ,  Al-Ars Zaid
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2017  号： BIBE  ページ： 119-124  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ゲノムデータの解析に伴う計算時間,DNA情報の配列決定に必要な実時間に数値解析部分に必要な時間からボトルネックをシフトさせるを低減にささげられている多くの研究。DNA配列決定は時間のかかるプロセスであり,すべての既存のDNA解析法はDNA配列決定を待つ解析を開始する前に仕上げる完全にしなければならない。本論文では,DNA配列決定は完全に終了前に,ゲノム解析を始める新しいDNA解析法を提案した。DNAリードはまだ配列決定の過程でゲノム解析を開始した。不完全リードの未知の塩基とその対応するベース品質スコアを予測するためのアルゴリズムを用いた。結果は未知の塩基と品質スコアを予測するこの方法は五十の未知塩基(配列決定時間の1日以上を削減)のための完全なデータセットを用いて90%以上の類似性を達成することを示した。ベース品質値予測方式は非常に正確であり,検出された変異体の類似性を0.45~%削減することだけであることを示した。しかし,はまだ知られていない塩基に対するより正確な予測スキームを導入した解析の有効性を5.8%までに室。Copyright 2018 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： *予測 ,  CPU時間 ,  *DNA【核酸】 ,  アルゴリズム ,  品質 ,  類似性 ,  数値解析
準シソーラス用語： 値予測 ,  スコア ,  DNA解析 ,  実時間 ,  *ゲノミクス ,  *DNA配列 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (4件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子操作  (EC02050B) ,  核酸一般  (EB04010U) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (3件)： DNA配列 ,  予測 ,  ゲノム解析