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J-GLOBAL ID：201802228045671544   整理番号：18A1799951

パーキンソン病の症例対照DNAメチル化データにおけるロジスティック回帰を用いた特徴選択:比較研究【JST・京大機械翻訳】

Feature selection using logistic regression in case-control DNA methylation data of Parkinson’s disease: A comparative study

著者 (3件)： Kakade Aishwarya (Department of Biotechnology, School of Life Sciences, University of Hyderabad, Hyderabad, Telangana 500 046, India) ,  Kumari Baby (Department of Biotechnology, School of Life Sciences, University of Hyderabad, Hyderabad, Telangana 500 046, India) ,  Dholaniya Pankaj Singh (Department of Biotechnology, School of Life Sciences, University of Hyderabad, Hyderabad, Telangana 500 046, India)
資料名： Journal of Theoretical Biology  (Journal of Theoretical Biology)
巻： 457  ページ： 14-18  発行年： 2018年 
JST資料番号： A0288B  ISSN： 0022-5193  CODEN： JTBIA  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Parkinson病(PD)は,黒質緻密部におけるドーパミン作動性ニューロンの変性により引き起こされる進行性神経障害として記述されている。疾患の病因は完全には理解されていないが,それは複雑な遺伝的,後成的および環境的相互作用と関連している。多くの研究は,PDの進行の支持における後成的修飾の役割を示している。本研究では,450Kの66試料から捕獲された1726の転写物のメチル化パターンを含むデータを分析した。それは43の対照と23の病気のサンプルを含む。特徴縮小のためにロジスティック回帰(LR)を用い,すべての特徴よりも改善された精度率で分類器を構築した。分類器の性能を他の特徴低減アプローチと比較した。ランダムフォレスト(RF)と主成分分析(PCA)。LRとRFによる特徴減少はPCAより良く機能した。COMT,DCTN1およびPRNPのような遺伝子に対応する特徴のいくつかは,LRによりユニークに同定され,PDにおいて有意な役割を果たすことが報告されている。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *特徴選択 ,  遺伝 ,  遺伝子 ,  カテコールメチルトランスフェラーゼ ,  ニューロパチー ,  相互作用 ,  *Parkinson病 ,  病因 ,  主成分分析 ,  *メチル化
準シソーラス用語： ランダムフォレスト ,  ドーパミン作動性ニューロン ,  黒質緻密部 ,  *ロジスティック回帰分析 ,  *DNAメチル化 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 特徴選択 ,  DNAメチル化データ ,  パーキンソン病 ,  ロジスティック回帰 ,  ランダムフォレスト

分類 (1件)： 神経の基礎医学  (GN01020W)

タイトルに関連する用語 (7件)： パーキンソン病 ,  症例 ,  対照 ,  DNAメチル化 ,  ロジスティック回帰 ,  特徴選択 ,  研究