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J-GLOBAL ID：201802228215911640   整理番号：18A1351764

Great Tit(Parus major)個体群の遺伝子型決定のための高密度SNPチップとその探索行動の遺伝的構造研究への応用【JST・京大機械翻訳】

A high-density SNP chip for genotyping great tit (Parus major) populations and its application to studying the genetic architecture of exploration behaviour

著者 (13件)： Kim J.-M. (Department of Animal & Plant Sciences, University of Sheffield, Sheffield, UK) ,  Kim J.-M. (Department of Animal Science and Technology, Chung-Ang University, Anseong, Gyeonggi-do, Korea) ,  Santure A. W. (Department of Animal & Plant Sciences, University of Sheffield, Sheffield, UK) ,  Santure A. W. (School of Biological Sciences, University of Auckland, Auckland, New Zealand) ,  Barton H. J. (Department of Animal & Plant Sciences, University of Sheffield, Sheffield, UK) ,  Quinn J. L. (School of Biological, Earth and Environmental Science (BEES), University College Cork, Cork, Ireland) ,  Cole E. F. (Department of Zoology, Edward Grey Institute, University of Oxford, Oxford, UK) ,  Great Tit HapMap Consortium ,  Visser M. E. (Department of Animal Ecology, Netherlands Institute of Ecology (NIOO-KNAW), Wageningen, Netherlands) ,  Sheldon B. C. (Department of Zoology, Edward Grey Institute, University of Oxford, Oxford, UK) ,  Groenen M. A. M. (Wageningen University and Research - Animal Breeding and Genomics, Wageningen, Netherlands) ,  van Oers K. (Department of Animal Ecology, Netherlands Institute of Ecology (NIOO-KNAW), Wageningen, Netherlands) ,  Slate J. (Department of Animal & Plant Sciences, University of Sheffield, Sheffield, UK)
資料名： Molecular Ecology Resources  (Molecular Ecology Resources)
巻： 18  号： 4  ページ： 877-891  発行年： 2018年 
JST資料番号： W2685A  ISSN： 1755-098X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 高密度SNPマイクロアレイ(SNPチップ)は,多数の個体において数千の多型を遺伝子タイピングするための迅速で正確で効率的な方法である。SNPチップはヒト遺伝学および動物および植物育種において日常的に使用されているが,進化および生態学研究においてはあまり広く使用されていない。本論文において,著者らは,大きなtit(Parus major)個体群のゲノミクス研究を実行するために設計された,約500,000のSNPを有する高密度Affymetrix Axiomチップの開発と応用について述べる。SNP遺伝子型エラー率は1%以下であり,チップは構造的またはコピー数変化の同定にも使用できることを実証した。このチップを用いて,広範囲にわたって広く研究されている人格形質である探索行動(EB)の遺伝的アーキテクチャを調べたが,SNPは遺伝的意義に達しなかったが,EBは遺伝的であり,多遺伝子構造を持つように見えた。類似のSNPチップを開発する研究者は注目すべきである。(i)代替プラットフォーム上で以前に分類されたSNPは,作業アッセイに変換される可能性が高い。(ii)1つ以上のパイプラインによりSNPを検出し,独立したデータセットにおいて,高い割合の作業分析を確実にする。(iii)対立遺伝子頻度確認バイアスは,複数の個体群からの個体におけるSNP発見を実行することによって最小化される。また,(iv)最低の呼率を持つサンプルは,最大の遺伝子タイピング誤り率を持つ傾向がある。Copyright 2018 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 動物 ,  *遺伝 ,  *遺伝子型 ,  ヒト ,  遺伝学 ,  作物育種 ,  生態学 ,  *個体群 ,  バイアス ,  遺伝子頻度 ,  コピー数 ,  *探索行動 ,  ゲノムワイド関連解析
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  マイクロアレイ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 公理 ,  CNV ,  探索行動 ,  GWAS ,  人格

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (9件)： Parus ,  個体 ,  遺伝子型決定 ,  高密度 ,  SNPチップ ,  探索行動 ,  遺伝的構造 ,  研究 ,  応用