文献

J-GLOBAL ID：201802228238209661   整理番号：18A0430517

ハイスループット細胞画像解析のためのハードウェア加速システム【Powered by NICT】

A hardware accelerated system for high throughput cellular image analysis

著者 (4件)： Lee Dajung (University of California, San Diego, 9500 Gilman Dr, La Jolla, CA 92122, USA) ,  Mehta Nirja (University of California, San Diego, 9500 Gilman Dr, La Jolla, CA 92122, USA) ,  Shearer Alexandria (University of California, San Diego, 9500 Gilman Dr, La Jolla, CA 92122, USA) ,  Kastner Ryan (University of California, San Diego, 9500 Gilman Dr, La Jolla, CA 92122, USA)
資料名： Journal of Parallel and Distributed Computing  (Journal of Parallel and Distributed Computing)
巻： 113  ページ： 167-178  発行年： 2018年 
JST資料番号： D0613B  ISSN： 0743-7315  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： イメージングフローサイトメトリーと高速顕微鏡は臨床診断,生物学的研究と創薬のための大きな有望性を示した。細胞の生物学的,化学的,および機械的特性を用いた高スループットスクリーニングおよび選別を可能にする。これらの技術は,未成熟から成熟細胞を分離し,癌細胞の存在を決定,分化中の幹細胞を分類し,それらは細胞構造にどのように影響するかに基づいた薬をスクリーニングした。プロセスが高率にイメージング細胞による,細胞の特徴(例えば,大きさ,位置,真円度,変形)を抽出し,細胞を分類するためにこれらの特徴を用いた。最新システムは千秒当たり二細胞の目標スループット,第二当たり60,000フレーム以上の速度で画像を必要とした。細胞特徴は実時間選別を可能にするミリ秒以内に計算しなければならない。これは両スループット及びレイテンシの観点から挑戦的な計算性能制約を生成する。本論文では,高スループット細胞画像解析のためのハードウェア加速システムを提案した。を注意深く厳密な計算上の要求を満たすためにアルゴリズムとそれらの対応するハードウェア実装を開発した。著者らのアルゴリズムは,低分解能顕微鏡画像からの細胞形態学的特徴を解析し,抽出する。著者らのハードウェア加速システムは二当り60,000フレーム以上で動作する0.068msの潜時であった。これは潜在性の点で類似したソフトウェアベースの解析よりもスループットの1400×より速く,335×良好であった。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 腫瘍細胞 ,  スクリーニング ,  待ち時間 ,  *ハードウェア ,  *画像分析 ,  顕微鏡 ,  アルゴリズム ,  幹細胞 ,  高速度 ,  細胞構成体 ,  *スループット ,  機械的性質 ,  *画像
準シソーラス用語： 顕微鏡画像 ,  *ハイスループット , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： ハードウェア加速 ,  医用画像解析 ,  サイトメトリー ,  再構成可能なハードウエア ,  FPGA ,  高スループット

分類 (1件)： ディジタル計算機方式一般  (JC02010O)

タイトルに関連する用語 (5件)： ハイスループット ,  細胞画像 ,  解析 ,  ハードウェア ,  加速