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J-GLOBAL ID：201802228305539436   整理番号：18A1643244

非致死的蛋白質成熟ストレス下の細菌蛋白質資源の最適配分【JST・京大機械翻訳】

Optimal Allocation of Bacterial Protein Resources under Nonlethal Protein Maturation Stress

著者 (5件)： Zhang Qing (Key Laboratory of Theoretical Physics, Institute of Theoretical Physics, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Li Rui (Key Laboratory of Theoretical Physics, Institute of Theoretical Physics, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Li Junbai (Institute of Chemistry, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Shi Hualin (Key Laboratory of Theoretical Physics, Institute of Theoretical Physics, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China) ,  Shi Hualin (School of Physical Sciences, University of Chinese Academy of Sciences, Beijing, China)
資料名： Biophysical Journal  (Biophysical Journal)
巻： 115  号： 5  ページ： 896-910  発行年： 2018年 
JST資料番号： B0298A  ISSN： 0006-3495  CODEN： BIOJAU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 異なる環境ストレス下で,細菌は種々の機構を通して細胞資源の配分を最適化する。最近,研究者は,代謝および翻訳制限下で細菌蛋白質資源の配分を定量的に特性化する現象論的モデルを用いている。いくつかのストレスは蛋白質成熟を妨げ,それによりシャペロンとプロテアーゼの発現を増強する。しかし,このような環境ストレスによって引き起こされる蛋白質資源の実現は定量的にモデル化されていない。ここでは,蛋白質成熟と分解を含む自己複製体に基づく粗粒蛋白質資源フラックスの動的モデルを開発した。磁束バランス解析を通して,解析的に解くことができる制約付き最適化問題を生成した。従って,異なる制限下での成長速度の関数として蛋白質配分画分を予測したが,これは基本的に実験データと一致した。異なる濃度のクロラムフェニコール,酢酸,パラコートを含む培地で大腸菌を培養し,構成的プロモーターにより駆動されるβ-ガラクトシダーゼの発現レベルと細菌増殖速度の間の機能的関係を測定した。フラックスに関する応力限界の可能なモードを考慮して,著者らのモデルはこの実験的に測定された関係を再現する。加えて,著者らのモデルは,大腸菌における不必要な蛋白質の成長速度とプロテオーム画分の間の実験的関係と良く一致し,役に立たない蛋白質過剰発現を伴うシャペロンの最適化されていないアップレギュレーションを考慮した。結果は,生物工学または医学的介入のための設計に役立つ可能性のある細菌ストレス適応のより系統的な見解を提供する。Copyright 2018 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： プロテオーム ,  モデリング ,  アップレギュレーション ,  シャペロンタンパク質 ,  キャラクタリゼーション ,  大腸菌 ,  *タンパク質 ,  β-ガラクトシダーゼ ,  *細菌 ,  プロモーター領域 ,  ペプチド結合ヒドロラーゼ ,  最適化 ,  ピリジニウム ,  芳香族ニトロ化合物 ,  抗生物質 ,  有機塩素化合物 ,  カルボアミド ,  アミノアルコール ,  ジオール ,  第二アルコール
準シソーラス用語： 過剰発現 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 微生物の生化学  (EG03020N) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  微生物生理一般  (EG03051L)

物質索引 (2件)： パラコート ,  クロラムフェニコール

タイトルに関連する用語 (6件)： 蛋白質 ,  成熟 ,  ストレス ,  細菌蛋白質 ,  資源 ,  最適配分