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J-GLOBAL ID：201802228310001569   整理番号：18A0806109

比較トランスクリプトーム解析はラズベリー(Rubus spp.)におけるプリモサトウキビ頂点発根の調節に潜在的に関与する候補遺伝子を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Comparative Transcriptome Analysis Reveal Candidate Genes Potentially Involved in Regulation of Primocane Apex Rooting in Raspberry (Rubus spp.)

著者 (6件)： Liu Jianfeng (Jilin Provincial Key Laboratory of Plant Resource Science and Green Production, Jilin Normal University) ,  Ming Yuetong (Jilin Provincial Key Laboratory of Plant Resource Science and Green Production, Jilin Normal University) ,  Cheng Yunqing (Jilin Provincial Key Laboratory of Plant Resource Science and Green Production, Jilin Normal University) ,  Zhang Yuchu (Jilin Provincial Key Laboratory of Plant Resource Science and Green Production, Jilin Normal University) ,  Xing Jiyang (Jilin Provincial Key Laboratory of Plant Resource Science and Green Production, Jilin Normal University) ,  Sun Yuqi (Jilin Provincial Key Laboratory of Plant Resource Science and Green Production, Jilin Normal University)
資料名： Frontiers in Plant Science (Web)  (Frontiers in Plant Science (Web))
巻： 8  ページ： 1036  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7094A  ISSN： 1664-462X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ラズベリー(Rubus spp.)は,プリモサトウキビの茎先端から開始されるユニークな発根過程を示し,この植物への生殖の異常な無性モードを与える。しかし,この過程に関与する遺伝子の完全な補完は同定されていない。この目的のために,本研究では,発根を調節する遺伝子を同定するために,デジタル遺伝子発現プロファイリングにより,3つの発生段階におけるRubus primoサトウキビおよびfloricane幹先端のトランスクリプトームを分析した。塩基配列決定とde novo集合は,26.82のヌクレオチドと59,173の単一遺伝子をもたらした。それぞれ,498,7346,4110,7900,9,397,および4,776の異なる発現遺伝子を,SAF1(発生段階1)対SAP2対SAP3,SAP1対SAP2,SAP1対SAP3およびSAP2対SAP3の対比較で同定した。SAP1は伸長成長パターンを維持した。SAP2は成長停止と垂直(下向き)重力屈性偏向を示した。最後に,短い根はSAP3の頂点に形成し始める。SAP1対SAP2のGeneとGenomes濃縮分析の京都Encyclopediaは,概日周期植物(ko04712)と植物ホルモンシグナル伝達(ko04075)を含むシュート成長停止と根分化に応答して活性化された12経路を明らかにした。著者らの結果は,概日リズム,エチレンおよびオーキシンのシグナル伝達,シュートの成長,および根の発達に関連する遺伝子が,Rubusにおける霊長類先端の発根の調節に潜在的に関与している可能性があることを示している。これらの知見は,この経済的に価値のある作物におけるプリモサトウキビ先端発根の分子機構を解明するための基礎を提供する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： オーキシン ,  農作物 ,  植物ホルモン ,  ヌクレオチド配列 ,  日周期 ,  *発根 ,  *遺伝子 ,  *サトウキビ ,  分化 ,  *トランスクリプトーム ,  *キイチゴ属 ,  アルケン
準シソーラス用語： 分子機構 ,  遺伝子発現プロファイリング ,  *トランスクリプトーム解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (3件)： Rubus ,  不定根 ,  トランスクリプトーム

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (1件)： エチレン

タイトルに関連する用語 (9件)： トランスクリプトーム解析 ,  ラズベリー ,  Rubus ,  SPP ,  サトウキビ ,  頂点 ,  発根 ,  調節 ,  候補遺伝子